Electrostatics of DNA nucleotide–carbon nanotube hybrids evaluated from QM:MM simulations
Notice bibliographique
Résumé
Biomolecule-functionalized carbon nanotubes (CNTs) have been studied vastly in recent years due to their potential applications for instance in cancer detection, purification and separation of CNTs, and nanoelectronics. Studying the electrostatic potential generated by a biomolecule-CNT hybrid is important in predicting its interactions with the surrounding environment such as charged particles and surfaces. In this paper, we performed atomistic simulations using a QM:MM approach to evaluate the electrostatic potential and charge transfer for a hybrid structure formed by a DNA nucleotide and a CNT in solution. Four types of DNA nucleotides and two CNTs with chiralities of (4,4) and (7,0) were considered. The types of nucleotides and CNTs were both found to play important roles in the electrostatic potential and charge transfer of the hybrid. At the same distance from the CNT axis, the electrostatic potential for the nucleotide-(4,4) CNT hybrids was found to be stronger compared with that for the nucleotide-(7,0) CNT hybrids. Higher electric charge was also shown to be transferred from the DNA nucleotides to the (7,0) CNT compared with the (4,4) CNT. These results correlate with the previous finding that the nucleotides bound more tightly to the (7,0) CNT compared with the (4,4) CNT.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».