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Enregistrement W2115422893 · doi:10.1111/j.1365-2052.2008.01710.x

Transcriptional analysis of host responses to Marek’s disease virus infection in genetically resistant and susceptible chickens

2008· article· en· W2115422893 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueAnimal Genetics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAgriculture and Agri-Food CanadaMinistry of Agriculture, Food and Rural AffairsOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsPoultry Industry CouncilNational Research FoundationOntario Innovation Trust
Mots-clésBiologyMarek's diseaseGeneMajor histocompatibility complexVirusVirologyImmune systemGene expression profilingGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Marek's disease virus (MDV) is a cell-associated oncogenic herpesvirus that targets B cells and T cells, inducing lymphoid tumours in chickens. Genetic resistance to Marek's disease (MD) is regulated in a polygenic fashion. In this study, we sought to compare the gene expression profiles following infection of birds that are genetically resistant or susceptible to MD (with the B21 and B19 haplotypes respectively at the MHC locus), including comparisons to uninfected controls. On days 4, 7, 14 and 21 post-infection, gene expression profiles in spleen tissue were obtained using a chicken immune-specific microarray. A number of genes showed significant (P <or= 0.05) differential expression across time and treatments. These included the chemokine AH221, B-cell marker Bu-1, IgG, IgA, IgM, MHC class II beta chain, granzyme A (GZMA) and signal transducers and activators of transcription 2 (STAT2) genes. In several comparisons, genes such as GZMA and STAT2 were induced in infected birds regardless of their genetic background. However, only immunoglobulin genes were differentially expressed by >or=2-fold in resistant compared with susceptible infected chickens. IgM and IgG were significantly induced on day 7 post-infection in susceptible chickens compared to resistant birds, whereas both of these genes were repressed in susceptible birds on day 14 post-infection. Overall, gene expression profiles in the chicken spleen observed after MDV infection were dependent on time and host genetic background. These gene expression profiles provide a platform for defining novel candidate genes for resistance or susceptibility to MD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,464

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle