Transcriptional analysis of host responses to Marek’s disease virus infection in genetically resistant and susceptible chickens
Notice bibliographique
Résumé
Summary Marek’s disease virus (MDV) is a cell‐associated oncogenic herpesvirus that targets B cells and T cells, inducing lymphoid tumours in chickens. Genetic resistance to Marek’s disease (MD) is regulated in a polygenic fashion. In this study, we sought to compare the gene expression profiles following infection of birds that are genetically resistant or susceptible to MD (with the B21 and B19 haplotypes respectively at the MHC locus), including comparisons to uninfected controls. On days 4, 7, 14 and 21 post‐infection, gene expression profiles in spleen tissue were obtained using a chicken immune‐specific microarray. A number of genes showed significant (P ≤ 0.05) differential expression across time and treatments. These included the chemokine AH221, B‐cell marker Bu‐1, IgG, IgA, IgM, MHC class II β chain, granzyme A (GZMA) and signal transducers and activators of transcription 2 (STAT2) genes. In several comparisons, genes such as GZMA and STAT2 were induced in infected birds regardless of their genetic background. However, only immunoglobulin genes were differentially expressed by ≥2‐fold in resistant compared with susceptible infected chickens. IgM and IgG were significantly induced on day 7 post‐infection in susceptible chickens compared to resistant birds, whereas both of these genes were repressed in susceptible birds on day 14 post‐infection. Overall, gene expression profiles in the chicken spleen observed after MDV infection were dependent on time and host genetic background. These gene expression profiles provide a platform for defining novel candidate genes for resistance or susceptibility to MD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».