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Enregistrement W2115490568 · doi:10.1158/2326-6066.cir-14-0236-t

Mass Cytometry Analysis Shows That a Novel Memory Phenotype B Cell Is Expanded in Multiple Myeloma

2015· article· en· W2115490568 sur OpenAlexaff
Leo Hansmann, Lisa K. Blum, Chia‐Hsin Ju, Michaela Liedtke, William H. Robinson, Mark M. Davis

Notice bibliographique

RevueCancer Immunology Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésImmunoglobulin DPopulationImmunologyBiologyMultiple myelomaPeripheral blood mononuclear cellAntibodyMemory B cellMass cytometryFlow cytometryB cellCancerCD19Cancer researchPhenotypeMedicineGeneticsGeneIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It would be very beneficial if the status of cancers could be determined from a blood specimen. However, peripheral blood leukocytes are very heterogeneous between individuals, and thus high-resolution technologies are likely required. We used cytometry by time-of-flight and next-generation sequencing to ask whether a plasma cell cancer (multiple myeloma) and related precancerous states had any consistent effect on the peripheral blood mononuclear cell phenotypes of patients. Analysis of peripheral blood samples from 13 cancer patients, 9 precancer patients, and 9 healthy individuals revealed significant differences in the frequencies of the T-cell, B-cell, and natural killer-cell compartments. Most strikingly, we identified a novel B-cell population that normally accounts for 4.0% ± 0.7% (mean ± SD) of total B cells and is up to 13-fold expanded in multiple myeloma patients with active disease. This population expressed markers previously associated with both memory (CD27(+)) and naïve (CD24(lo)CD38(+)) phenotypes. Single-cell immunoglobulin gene sequencing showed polyclonality, indicating that these cells are not precursors to the myeloma, and somatic mutations, a characteristic of memory cells. SYK, ERK, and p38 phosphorylation responses, and the fact that most of these cells expressed isotypes other than IgM or IgD, confirmed the memory character of this population, defining it as a novel type of memory B cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,111
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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