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Enregistrement W2115587716 · doi:10.1042/bj20031205

Coagulation factor Va Glu-96-Asp-111: a chelator-sensitive site involved in function and subunit association

2004· article· en· W2115587716 sur OpenAlexafffund
Abed R. Zeibdawi, Jean E. Grundy, Bogna LASIA, Edward L.G. Pryzdial

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaCanadian Blood ServicesUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Blood ServicesHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésDivalentChemistryProtein subunitThrombinMutantChelationSerineStereochemistryFactor XWild typeBiochemistryBiologyPlateletEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Coagulation FVa (factor Va) accelerates the essential generation of thrombin by FXa (factor Xa). Although the noncovalent Ca2+-dependent association between the FVa light and heavy subunits (FVaL and FVaH) is required for function, little is known about the specific residues involved. Previous fragmentation studies and homology modelling led us to investigate the contribution of Leu-94-Asp-112. Including prospective divalent cation-binding acidic amino acids, nine conserved residues were individually replaced with Ala in the recombinant B-domainless FVa precursor (DeltaFV). While mutation of Thr-104, Glu-108, Asp-112 or Tyr-100 resulted in only minor changes to FXa-mediated thrombin generation, the functions of E96A (81%), D111A (70%) and D102A (60%) mutants (where the single-letter amino acid code is used) were notably reduced. The mutants targeting neighbouring acidic residues, Asp-79 and Glu-119, had activity comparable with DeltaFV, supporting the specific involvement of select residues. Providing a basis for reduced activity, thrombin treatment of D111A resulted in spontaneous dissociation of subunits. Since FVaH and FVaL derived from E96A or D102A remained associated in the presence of Ca2+, like the wild type, but conversely dissociated rapidly upon chelation, a subtle difference in divalent cation co-ordination is implied. Subunit interactions for all other single-point mutants resembled the wild type. These data, along with corroborating multipoint mutants, reveal Asp-111 as essential for FVa subunit association. Although Glu-96 and Asp-102 can be mutated without gross changes to divalent cation-dependent FVaH-FVaL interactions, they too are required for optimal function. Thus Glu-96-Asp-111 imparts at least two discernible effects on FVa coagulation activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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