Delineating genetic groupings in continuously distributed species across largely homogeneous landscapes: a study of American black bears (<i>Ursus americanus</i>) in Ontario, Canada
Notice bibliographique
Résumé
There is a crucial need to understand the genetic consequences of landscape modifications on continuous populations that could become fragmented, and to evaluate the degree of differentiation of isolated populations that were historically part of the core. Using 15 microsatellite loci, we evaluated the genetic structure of American black bears ( Ursus americanus Pallas, 1780) across a vast, contiguous Ontario landscape (>1 × 106km2) that largely represents their pre-European settlement distribution. Because geographic barriers are absent, we predicted that isolation by distance would drive genetic structure. We identified three genetic clusters (Northwest, Southeast, and Bruce Peninsula) that were less differentiated than when assessed with mtDNA, suggesting the influence of male-biased dispersal on large-scale genetic differentiation. Isolation by distance (r = 0.552, P = 0.001) was supported by a weak, clinal variation between Northwest and Southeast, illustrating the challenges to delineate populations in wide-ranging taxa. The Bruce Peninsula cluster, confined to a small area under strong anthropogenic pressures, was more differentiated from neighbouring clusters (FST > 0.13, P < 0.0001), with a genetic diversity corresponding to disjunct populations of black bears. Our results could be used in landscape genetics models to project the evolution of population differentiation based on upcoming landscape modifications in northern regions of North America.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».