Evolutionary conservation of the oocyte transcriptome among vertebrates and its implications for understanding human reproductive function
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Cross-phylum and cross-species comparative transcriptomic analyses provide an evolutionary perspective on how specific tissues use genomic information. A significant mRNA subset present in the oocytes of most vertebrates is stabilized or stored for post-LH surge use. Since transcription is arrested in the oocyte before ovulation, this RNA is important for completing maturation and sustaining embryo development until zygotic genome activation. We compared the human oocyte transcriptome with an oocyte-enriched subset of mouse, bovine and frog (Xenopus laevis) genes in order to evaluate similarities between species. Graded temperature stringency hybridization on a multi-species oocyte cDNA array was used to measure the similarity of preferentially expressed sequences to the human oocyte library. Identity analysis of 679 human orthologs compared with each identified official gene symbol found in the subtractive (somatic-oocyte) libraries comprising our array revealed that bovine/human similarity was greater than mouse/human or frog/human similarity. However, based on protein sequence, mouse/human similarity was greater than bovine/human similarity. Among the genes over-expressed in oocytes relative to somatic tissue in Xenopus, Mus and Bos, a high level of conservation was found relative to humans, especially for genes involved in early embryonic development.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle