Localization of Large ADP-Ribosylation Factor-Guanine Nucleotide Exchange Factors to Different Golgi Compartments: Evidence for Distinct Functions in Protein Traffic
Notice bibliographique
Résumé
Activation of several ADP-ribosylation factors (ARFs) by guanine nucleotide exchange factors (GEFs) regulates recruitment of coat proteins (COPs) on the Golgi complex and is generally assumed to be the target of brefeldin A (BFA). The large ARF-GEFs Golgi-specific BFA resistance factor 1 (GBF1) and BFA-inhibited GEFs (BIGs) localize to this organelle but catalyze exchange preferentially on class II and class I ARFs, respectively. We now demonstrate using quantitative confocal microscopy that these GEFs show a very limited overlap with each other (15 and 23%). In contrast, GBF1 colocalizes with the cis-marker p115 (86%), whereas BIGs overlap extensively with TGN38 (83%). Consistent with these distributions, GBF1, but not BIG1, partially relocalized to peripheral sites after incubation at 15 degrees C. The new GBF1 structures represent peripheral vesicular tubular clusters (VTCs) because 88% of structures analyzed stained for both GBF1 and p115. Furthermore, as expected of VTCs, they rapidly reclustered to the Golgi complex in a microtubule-dependent manner upon warm-up. These observations suggest that GBF1 and BIGs activate distinct subclasses of ARFs in specific locations to regulate different types of reactions. In agreement with this possibility, COPI overlapped to a greater extent with GBF1 (64%) than BIG1 (31%), whereas clathrin showed limited overlap with BIG1, and virtually none with GBF1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».