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Enregistrement W2115823159 · doi:10.1074/jbc.m000508200

Recruitment of a Foreign Quinone into the A1 Site of Photosystem I

2000· article· en· W2115823159 sur OpenAlexaff
Alexey Yu. Semenov, Ilya R. Vassiliev, Art van der Est, Mahir D. Mamedov, Boris Zybailov, Gaozhong Shen, D. Stehlik, Bruce A. Diner, Parag R. Chitnis, John H. Golbeck

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhotosystem IIQuinoneChemistryPhotosynthesisPhotochemistryBiophysicsBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interruption of the menA or menB gene in Synechocystis sp. PCC 6803 results in the incorporation of a foreign quinone, termed Q, into the A(1) site of photosystem I with a number of experimental indicators identifying Q as plastoquinone-9. A global multiexponential analysis of time-resolved optical spectra in the blue region shows the following three kinetic components: 1) a 3-ms lifetime in the absence of methyl viologen that represents charge recombination between P700(+) and an FeS(-) cluster; 2) a 750-microseconds lifetime that represents electron donation from an FeS(-) cluster to methyl viologen; and 3) an approximately 15-microseconds lifetime that represents an electrochromic shift of a carotenoid pigment. Room temperature direct detection transient EPR studies of forward electron transfer show a spectrum of P700(+) Q(-) during the lifetime of the spin polarization and give no evidence of a significant population of P700(+) FeS(-) for t </= 2-3 microseconds. The UV difference spectrum measured 5 microseconds after a flash shows a maximum at 315 nm, a crossover at 280 nm, and a minimum at 255 nm as well as a shoulder at 290-295 nm, all of which are characteristic of the plastoquinone-9 anion radical. Kinetic measurements that monitor Q at 315 nm show a major phase of forward electron transfer to the FeS clusters with a lifetime of approximately 15 microseconds, which matches the electrochromic shift at 485 nm of the carotenoid, as well as an minor phase with a lifetime of approximately 250 microseconds. Electrometric measurements show similar biphasic kinetics. The slower kinetic phase can be detected using time-resolved EPR spectroscopy and has a spectrum characteristic of a semiquinone anion radical. We estimate the redox potential of plastoquinone-9 in the A(1) site to be more oxidizing than phylloquinone so that electron transfer from Q(-) to F(X) is thermodynamically unfavorable in the menA and menB mutants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,287

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations98
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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