Testing historical phylogeographic inferences with contemporary gene flow data: population genetic structure of the Qinghai toad‐headed lizard
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Using data from 11 microsatellite DNA loci and a population genetic approach, the phylogeographic patterns of the Qinghai toad‐headed lizard Phrynocephalus vlangalii revealed by mitochondrial DNA (mtDNA) were tested and the congruence between the nuclear and mitochondrial genes was examined. Both analysis of molecular variance (AMOVA) and BARRIER analyses suggested that the Arjin and the A'nyemaqen Mountains were significant genetic barriers to contemporary gene flow of the P. vlangalii populations. On the other hand, the Qaidam populations, where no major mountains are present, showed a weak but significant isolation by distance pattern. The patterns of population genetic structure were largely congruent with the phylogeographic patterns inferred from the mtDNA, and therefore, supported the hypothesis that the uplift of the Arjin and the A'nyemaqen Mountains caused the initial vicariant events that led to the formation of the diverged lineages within P. vlangalii . The only major difference between the mtDNA and nuclear DNA (nuDNA) results was the allocation of variance to different hierarchical levels in AMOVA. While the among group component, which were defined by mountains, accounted for most of the mitochondrial variance (81.73%), most of the nuDNA variance was at the among individuals within population level (83.69%). Differences in effective population sizes, social structure and male/female dispersal patterns might have contributed to the discrepancy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».