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Enregistrement W2115958000 · doi:10.1093/toxsci/kfg158

Compromised DNA Repair Enhances Sensitivity of the Yeast RNR3-lacZ Genotoxicity Testing System

2003· article· en· W2115958000 sur OpenAlexaff
Xuming Jia

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA repairNucleotide excision repairPostreplication repairBiologyDNA damageDNAlac operonBase excision repairGenotoxicitySaccharomyces cerevisiaeGeneSOS responseGeneticsMolecular biologyCell biologyChemistryPlasmid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The RNR3-lacZ genotoxicity testing system was developed based on the induction of a Saccharomyces cerevisiae RNR3-lacZ reporter gene in response to a broad range of DNA-damaging agents. In order to enhance the sensitivity of the RNR3-lacZ system, several deletion mutant strains representing different repair pathways were created and examined for their effects on RNR3-lacZ expression. It was found that inactivation of different DNA repair pathways has profound effects on the DNA damage induction of RNR3 expression. Although deletion of MAG1 in the base excision repair pathway enhances the detection sensitivity to DNA-alkylating agents, and deletion of RAD2 in the nucleotide excision repair pathway enhances the detection sensitivity to ultraviolet and agents that produce bulky lesions, inactivation of genes involved in the recombination repair and postreplication repair variably reduces RNR3-lacZ induction. This study not only helps to establish a more sensitive genotoxicity testing system but also suggests that certain eukaryotic DNA repair pathways are required for gene regulation in response to DNA damage and probably serve as sensors in the signal transduction cascade.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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