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Enregistrement W2115958535 · doi:10.1139/g05-030

Genetic analysis and high-resolution mapping of a premature senescence gene<i>Pse(t)</i>in rice (<i>Oryza sativa</i>L.)

2005· article· en· W2115958535 sur OpenAlexvenueno aff
Fuzhen Li, Guocheng Hu, Yaping Fu, Huamin Si, Xuemei Bai, Sun Zongxiu

Notice bibliographique

RevueGenome · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGABA and Rice Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneticsOryza sativaLocus (genetics)GenePopulationMutantSenescenceGene mappingGenetic analysisPositional cloningGenetic linkageChromosomeMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A rice mutant, designated pse(t) (premature senescence, tentatively), was isolated from a T-DNA-inserted transgenic population. Senescence advanced more markedly in pse(t) than in wild-type ('Zhonghua 11', japonica) plants. Genetic analysis of pse(t) revealed that the premature senescence mutation was controlled by a single recessive nuclear gene, but that it was not induced by T-DNA insertion. In an effort to understand the genetic and molecular basis underlying premature senescence in rice, a map-based cloning strategy was used to localize Pse(t). High-resolution mapping of the Pse(t) locus was carried out using simple sequence repeat (SSR) and cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS) markers. An F2 population, comprising 1691 pse(t) individuals derived from a cross of the pse(t) mutant with 'Longtepu' (indica), was constructed. Several new polymorphism markers were developed in this study. Genetic linkage analysis showed that the Pse(t) gene was located on the long arm of chromosome 7. It was found that the Pse(t) gene cosegregated with 3 markers and was flanked by markers SS22 and PP21. Thus, the Pse(t) gene is located within a genetic distance of 0.15 cM, corresponding to a physical distance of 220 kb. These findings provide the basic information that can be used for the final isolation of this gene in the rice premature-senescence pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,974
Score d'incertitude au seuil0,172

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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