Mitochondrial Cytochrome b DNA Variation in the High-Fecundity Atlantic Cod: Trans-Atlantic Clines and Shallow Gene Genealogy
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Notice bibliographique
Résumé
An analysis of sequence variation of 250 bp of the mitochondrial cytochrome b gene of 1278 Atlantic cod Gadus morhua ranging from Newfoundland to the Baltic shows four high-frequency (>8%) haplotypes and a number of rare and singleton haplotypes. Variation is primarily synonymous mutations. Natural selection acting directly on these variants is either absent or very weak. Common haplotypes show regular trans-Atlantic clines in frequencies and each of them reaches its highest frequency in a particular country. A shallow multifurcating constellation gene genealogy implies young age and recent turnover of polymorphism. Haplotypes characterizing populations at opposite ends of the geographic distribution in Newfoundland and the Baltic are mutationally closest together. The haplotypes are young and have risen rapidly in frequency. Observed differentiation among countries is due primarily to clinal variation. Hypotheses of historical isolation and polymorphisms balanced by local selection and gene flow are unlikely. Instead the results are explained by demic selection of mitochondria carried by highly fit females winning reproductive sweepstakes. By inference the Atlantic cod, a very high-fecundity vertebrate, is characterized by a high variance of offspring number and strong natural selection that leads to very low effective to actual population sizes.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle