Genome Stability of Arabidopsis atm, ku80 and rad51b Mutants: Somatic and Transgenerational Responses to Stress
Notice bibliographique
Résumé
DNA double-strand breaks (DSBs) can be repaired via two main mechanisms: non-homologous end joining (NHEJ) and homologous recombination (HR). Our previous work showed that exposure to abiotic stresses resulted in an increase in point mutation frequency (PMF) and homologous recombination frequency (HRF), and these changes were heritable. We hypothesized that mutants impaired in DSB recognition and repair would also be deficient in somatic and transgenerational changes in PMF and HRF. To test this hypothesis, we analyzed the genome stability of the Arabidopsis thaliana mutants deficient in ATM (communication between DNA strand break recognition and the repair machinery), KU80 (deficient in NHEJ) and RAD51B (deficient in HR repair) genes. We found that all three mutants exhibited higher levels of DSBs. Plants impaired in ATM had a lower spontaneous PMF and HRF, whereas ku80 plants had higher frequencies. Plants impaired in RAD51B had a lower HRF. HRF in wild-type, atm and rad51b plants increased in response to several abiotic stressors, whereas it did not increase in ku80 plants. The progeny of stressed wild-type and ku80 plants exhibited an increase in HRF in response to all stresses, and the increase was higher in ku80 plants. The progeny of atm plants showed an increase in HRF only when the parental generation was exposed to cold or flood, whereas the progeny of rad51b plants completely lacked a transgenerational increase in HRF. Our experiments showed that mutants impaired in the recognition and repair of DSBs exhibited changes in the efficiency of DNA repair as reflected by changes in strand breaks, point mutation and HRF. They also showed that the HR RAD51B protein and the protein ATM that recognized damaged DNA might play an important role in transgenerational changes in HRF.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».