Gene Expression Profiles of Luteal Phase Fallopian Tube Epithelium from <i>BRCA</i> Mutation Carriers Resemble High-Grade Serous Carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: To identify molecular alterations potentially involved in predisposition to adnexal serous carcinoma (SerCa) in the nonmalignant fallopian tube epithelium (FTE) of BRCA1/2 mutation carriers, given recent evidence implicating the distal FTE as a common source for SerCa. EXPERIMENTAL DESIGN: We obtained and compared gene expression profiles of laser capture microdissected nonmalignant distal FTE from 12 known BRCA1/2 mutation carriers (FTEb) and 12 control women (FTEn) during the luteal and follicular phase, as well as 13 high-grade tubal and ovarian SerCa. RESULTS: Gene expression profiles of tubal and ovarian SerCa specimens were indistinguishable by unsupervised cluster analysis and significance analysis of microarrays. FTEb samples as a group, and four individual FTEb samples from the luteal phase in particular, clustered closely with SerCa rather than normal control FTE. Differentially expressed genes from these four samples relative to other FTEb samples, as well as differentially expressed genes in all FTEb luteal samples relative to follicular samples, were mapped to the I2D protein-protein interaction database, revealing a complex network affecting signaling pathways previously implicated in tumorigenesis. Two candidates, disabled homolog 2 mitogen-responsive phosphoprotein (DAB2) and Ski-like (SKIL), were further validated by real-time reverse transcription-PCR and tissue arrays. FTEb luteal and SerCa samples expressed higher levels of oncogenic SKIL and decreased levels of tumor suppressor DAB2, relative to FTEb follicular samples. CONCLUSIONS: These findings support a common molecular pathway for adnexal SerCa and implicate factors associated with the luteal phase in predisposition to ovarian cancer in BRCA mutation carriers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».