Next-Gen sequencing of the transcriptome of triticale
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Triticale possesses favourable agronomic attributes originating from both its wheat and rye progenitors, including high grain and biomass yields. Triticale, primarily used as animal feed in North America, is an excellent candidate for production of industrial bio-products. Little is known about the coordination of gene expression of rye and wheat genomes in this intergeneric hybrid, but significant DNA losses from the parental genomes have been reported. To clarify the regulation of gene expression in triticale, we carried out 454 sequencing of cDNAs obtained from root, leaf, stem and floral tissues in different lines of triticale and rye exhibiting different phenotypes and assembled reads into contigs. Related to the data assembly were the absence of reference genomes and the paucity of rye sequences in GenBank or other public databases. Consequently, we have sequenced cDNA libraries from roots, seedlings, leaves, floral tissues and immature seeds to facilitate the identification of triticale sequences originating from rye. To further characterize the wheat-derived cDNAs, we also developed a database close to 25,000 non-redundant full-length wheat coding sequence genes, based on existing databases and contigs that were verified against protein sequences from the grass genomes of Brachypodium distachyon , rice, sorghum and maize.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle