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Enregistrement W2116216528 · doi:10.3899/jrheum.091468

Lack of Association of C-C Chemokine Receptor 5 Δ32 Deletion Status with Rheumatoid Arthritis, Systemic Lupus Erythematosus, Lupus Nephritis, and Disease Severity

2010· article· en· W2116216528 sur OpenAlexvenueno aff
H. A. Martens, SACHA GROSS, Gerrit van der Steege, Elisabeth Brouwer, Jo H. M. Berden, RUUD de SEVAUX, Ronald H. W. M. Derksen, Alexandre E. Voskuyl, Stefan P. Berger, Gerjan Navis, Cees G. M. Kallenberg, Marc Bijl

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemokine receptors and signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineRheumatoid arthritisImmunologyGenotypeLupus nephritisNephritisInternal medicineArthritisLupus erythematosusAutoimmune diseasePopulationDiseaseGastroenterologyGeneBiologyAntibodyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: C-C chemokine receptor 5 (CCR5) plays an important role in inflammation. A 32 base-pair (Δ32) deletion in the CCR5 gene leads to a nonfunctional receptor. This deletion has been reported to have a protective effect on the development and progression of several autoimmune diseases. We investigated whether the Δ32 deletion is associated with disease susceptibility in a population of patients with rheumatoid arthritis (RA), systemic lupus erythematosus (SLE), and lupus nephritis (LN); and whether it is associated with disease severity. METHODS: DNA samples from 405 RA patients, 97 SLE patients, 113 LN patients, and 431 healthy controls were genotyped for the CCR5 Δ32 deletion. Differences in genotype frequencies were tested between patients and controls. Association of genotypes with disease severity was analyzed. RESULTS: Genotype frequencies of each group were in Hardy-Weinberg equilibrium. The genotype frequencies of patients did not differ significantly from controls (CCR5/Δ32, Δ32/Δ32: RA 18.3% and 1.2%, respectively; SLE 17.5% and 2.1%; LN 13.3% and 1.8%; controls 20.0% and 2.8%). However, there was a trend for lower Δ32 deletion allele frequency in LN patients compared to controls (p = 0.08). There was no significant association between the CCR5 status and disease severity in RA, SLE, or LN. CONCLUSION: Although an association with LN cannot be excluded, the CCR5 Δ32 deletion does not seem to be a disease susceptibility genotype for RA, SLE, or LN. No significant effect of the Δ32 deletion on disease severity was demonstrated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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