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Enregistrement W2116232319 · doi:10.1074/jbc.m113.521815

Plant Acyl-CoA:Lysophosphatidylcholine Acyltransferases (LPCATs) Have Different Specificities in Their Forward and Reverse Reactions

2013· article· en· W2116232319 sur OpenAlexaff
Ida Lager, Jenny Lindberg Yilmaz, Xue‐Rong Zhou, Katarzyna Jasieniecka‐Gazarkiewicz, Michael Kazachkov, Peng Wang, Jitao Zou, Randall J. Weselake, Mark Smith, Shen Bayon, John M. Dyer, Jay Shockey, Ernst Heinz, Allan Green, Antoni Banaś, Sten Stymne

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of AlbertaSaskatchewan Research Council (Canada)
Organismes subventionnairesSvenska Forskningsrådet FormasVINNOVAEuropean CommissionNational Science Foundation
Mots-clésAcyltransferasesAcyl-CoAAcylationAcyltransferaseBiochemistryArabidopsisAcyl groupLysophosphatidylcholinePhosphatidylcholineEnzymeBiologyYeastArabidopsis thalianaBiosynthesisChemistryGenePhospholipidMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acyl-CoA:lysophosphatidylcholine acyltransferase (LPCAT) enzymes have central roles in acyl editing of phosphatidylcholine (PC). Plant LPCAT genes were expressed in yeast and characterized biochemically in microsomal preparations of the cells. Specificities for different acyl-CoAs were similar for seven LPCATs from five different species, including species accumulating hydroxylated acyl groups in their seed oil, with a preference for C18-unsaturated acyl-CoA and low activity with palmitoyl-CoA and ricinoleoyl (12-hydroxyoctadec-9-enoyl)-CoA. We showed that Arabidopsis LPCAT1 and LPCAT2 enzymes catalyzed the acylation and de-acylation of both sn positions of PC, with a preference for the sn-2 position. When acyl specificities of the Arabidopsis LPCATs were measured in the reverse reaction, sn-2-bound oleoyl, linoleoyl, and linolenoyl groups from PC were transferred to acyl-CoA to a similar extent. However, a ricinoleoyl group at the sn-2-position of PC was removed 4–6-fold faster than an oleoyl group in the reverse reaction, despite poor utilization in the forward reaction. The data presented, taken together with earlier published reports on in vivo lipid metabolism, support the hypothesis that plant LPCAT enzymes play an important role in regulating the acyl-CoA composition in plant cells by transferring polyunsaturated and hydroxy fatty acids produced on PC directly to the acyl-CoA pool for further metabolism or catabolism. Acyl-CoA:lysophosphatidylcholine acyltransferase (LPCAT) enzymes have central roles in acyl editing of phosphatidylcholine (PC). Plant LPCAT genes were expressed in yeast and characterized biochemically in microsomal preparations of the cells. Specificities for different acyl-CoAs were similar for seven LPCATs from five different species, including species accumulating hydroxylated acyl groups in their seed oil, with a preference for C18-unsaturated acyl-CoA and low activity with palmitoyl-CoA and ricinoleoyl (12-hydroxyoctadec-9-enoyl)-CoA. We showed that Arabidopsis LPCAT1 and LPCAT2 enzymes catalyzed the acylation and de-acylation of both sn positions of PC, with a preference for the sn-2 position. When acyl specificities of the Arabidopsis LPCATs were measured in the reverse reaction, sn-2-bound oleoyl, linoleoyl, and linolenoyl groups from PC were transferred to acyl-CoA to a similar extent. However, a ricinoleoyl group at the sn-2-position of PC was removed 4–6-fold faster than an oleoyl group in the reverse reaction, despite poor utilization in the forward reaction. The data presented, taken together with earlier published reports on in vivo lipid metabolism, support the hypothesis that plant LPCAT enzymes play an important role in regulating the acyl-CoA composition in plant cells by transferring polyunsaturated and hydroxy fatty acids produced on PC directly to the acyl-CoA pool for further metabolism or catabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,506

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations155
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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