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Enregistrement W2116266744 · doi:10.1002/bip.20820

Dense‐core and diffuse Aβ plaques in TgCRND8 mice studied with synchrotron FTIR microspectroscopy

2007· article· en· W2116266744 sur OpenAlexaff
Margaret Rak, Marc R. Del Bigio, Sabine Mai, David Westaway, Kathleen Gough

Notice bibliographique

RevueBiopolymers · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversity of AlbertaCancerCare ManitobaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryHippocampal formationFibrilSynchrotronBiophysicsProtein secondary structurePathologyCrystallographyBiochemistryNeuroscienceOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Plaques composed of the Aβ peptide are the main pathological feature of Alzheimer's disease. Dense‐core plaques are fibrillar deposits of Aβ, showing all the classical properties of amyloid including β‐sheet secondary structure, while diffuse plaques are amorphous deposits. We studied both plaque types, using synchrotron infrared (IR) microspectroscopy, a technique that allows the chemical composition and average protein secondary structure to be investigated in situ. We examined plaques in hippocampal, cortical and caudal tissue from 5‐ to 21‐month‐old TgCRND8 mice, a transgenic model expressing doubly mutant amyloid precursor protein, and displaying impaired hippocampal function and robust pathology from an early age. Spectral analysis confirmed that the congophilic plaque cores were composed of protein in a β‐sheet conformation. The amide I maximum of plaque cores was at 1623 cm−1, and unlike for in vitro Aβ fibrils, the high‐frequency (1680–1690 cm−1) component attributed to antiparallel β‐sheet was not observed. A significant elevation in phospholipids was found around dense‐core plaques in TgCRND8 mice ranging in age from 5 to 21 months. In contrast, diffuse plaques were not associated with IR detectable changes in protein secondary structure or relative concentrations of any other tissue components. © 2007 Wiley Periodicals, Inc. Biopolymers 87: 207–217, 2007. This article was originally published online as an accepted preprint. The “Published Online” date corresponds to the preprint version. You can request a copy of the preprint by emailing the Biopolymers editorial office at biopolymers@wiley.com

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations90
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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