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Enregistrement W2116282320 · doi:10.1074/jbc.m409047200

TIN2 Binds TRF1 and TRF2 Simultaneously and Stabilizes the TRF2 Complex on Telomeres

2004· article· en· W2116282320 sur OpenAlexaff
Jeffrey Zheng-Sheng Ye, Jill R. Donigian, Megan van Overbeek, Diego Loayza, Yan Luo, Andrew N. Krutchinsky, Brian T. Chait, Titia de Lange

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensIONICS Mass Spectrometry (Canada)
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésTelomereShelterinRap1ImmunoprecipitationBiologyTelomere-binding proteinCell biologyMolecular biologyRNADNAGeneticsDNA-binding proteinGeneTranscription factorSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human telomeres contain two related telomeric DNA-binding proteins, TRF1 and TRF2. The TRF1 complex contains the TRF1 interacting partner, TIN2, as well as PIP1 and POT1 and regulates telomere-length homeostasis. The TRF2 complex is primarily involved in telomere protection and contains the TRF2 interacting partner human (h)Rap1 as well as several factors involved in the DNA damage response. A prior report showed that conditional deletion of murine TRF1 reduced the presence of TRF2 on telomeres. Here we showed that TRF2 is also lost from human telomeres upon TRF1 depletion with small interfering RNA prompting a search for the connection between the TRF1 and TRF2 complexes. Using mass spectrometry and co-immunoprecipitation, we found that TRF1, TIN2, PIP1, and POT1 are associated with the TRF2-hRap1 complex. Gel filtration identified a TRF2 complex containing TIN2 and POT1 but not TRF1 indicating that TRF1 is not required for this interaction. Co-immunoprecipitation, Far-Western assays, and two-hybrid assays showed that TIN2, but not POT1 or PIP1, interacts directly with TRF2. Furthermore, TIN2 was found to bind TRF1 and TRF2 simultaneously, showing that TIN2 can link these telomeric proteins. This connection appeared to stabilize TRF2 on the telomeres as the treatment of cells with TIN2 small interfering RNA resulted in a decreased presence of TRF2 and hRap1 at chromosome ends. The TIN2-mediated cooperative binding of TRF1 and TRF2 to telomeres has important implications for the mechanism of telomere length regulation and protection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations345
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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