MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2116359050 · doi:10.2174/092986610792231519

Identification of N- and C-Terminal Residues Involved in MAP Kinase Phosphatase 3 (MKP3) Interdomain Binding and Auto-Inhibition

2010· article· en· W2116359050 sur OpenAlex
John K. Mark, Michael Johnston, Mary Alice Hefford

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueProtein and Peptide Letters · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversity of OttawaHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphataseIdentification (biology)Terminal (telecommunication)KinaseBiochemistryDUSP6PyrophosphatasesChemistryComputational biologyBiologyCell biologyEnzymeComputer scienceProtein phosphatase 2Botany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interdomain binding has been shown to play an important role in the regulation of MAP kinase phosphatase 3 (MKP3), a phosphatase involved in control of ERK signalling pathways. In this study the residues in N- and C-terminal domains responsible for MKP3 interdomain binding are identified. Peptides from the N-terminal substrate-binding domain of MKP3 were assessed for their ability to bind the C-terminal catalytic domain using surface plasmon resonance. The data indicate that the residues 77-97 (the Post-KIM peptide) in the MKP3 N-terminal domain are responsible for its binding to the C-terminal catalytic domain. Residues in the C-terminal domain that might be important to interdomain binding were identified using data in the existing literature. Variants in which these residues had been altered were examined by circular dichroism and enzymatic assays to ensure retention of their structure and catalytic properties before being assessed for their ability to bind the Post-KIM peptide. The data show that glutamic acid 248, asparagine 267 and, to a lesser extent, arginine 299 are important for the interaction between the MKP3 C-terminal and the N-terminal domains. The identified residues map to a region on the surface of the C-terminal domain that appears complementary to the N-terminal domain surface defined by the Post-KIM peptide. This interdomain binding site is distinct from the substrate interaction sites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,597

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle