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Enregistrement W2116367613 · doi:10.1111/jnc.12928

A two‐hybrid screen identifies an unconventional role for the intermediate filament peripherin in regulating the subcellular distribution of the SNAP25‐interacting protein, SIP30

2014· article· en· W2116367613 sur OpenAlexafffund
Benoît J. Gentil, Jesse R. McLean, Shangxi Xiao, Beibei Zhao, Heather D. Durham, Janice Robertson

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurochemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSkin and Cellular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthALS Society of Canada
Mots-clésPeripherinBiologyCell biologyIntermediate filamentSNAP25Gene isoformIntermediate Filament ProteinProtein filamentGeneticsSynaptic vesicleVesicleGeneCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Peripherin is a type III intermediate filament protein, the expression of which is associated with the acquisition and maintenance of a terminally differentiated neuronal phenotype. Peripherin up‐regulation occurs during acute neuronal injury and in degenerating motor neurons of amyotrophic lateral sclerosis. The functional role(s) of peripherin during normal, injurious, and disease conditions remains unknown, but may be related to differential expression of spliced isoforms. To better understand peripherin function, we performed a yeast two‐hybrid screen on a mouse brain cDNA library using an assembly incompetent peripherin isoform, Per‐61, as bait. We identified new peripherin interactors with roles in vesicular trafficking, signal transduction, DNA/RNA processing, protein folding, and mitochondrial metabolism. We focused on the interaction of Per‐61 and the constitutive isoform, Per‐58, with SNAP25 interacting protein 30 (SIP30), a neuronal protein involved in SNAP receptor‐dependent exocytosis. We found that peripherin and SIP30 interacted through coiled‐coil domains and colocalized in cytoplasmic aggregates in SW13vim(−) cells. Interestingly, Per‐61 and Per‐58 differentially altered the subcellular distribution of SIP30 and SNAP25 in primary motor neurons. Our findings suggest a novel role of peripherin in vesicle trafficking. image The functional roles of the intermediate filament peripherin remain enigmatic. We performed a two‐hybrid screen and identified that peripherin interacts with SIP30 (a), a vesicle trafficking protein. Per‐58 and toxic Per‐61 isoforms coaggregated with SIP30 in SW13vim(−) cells and altered SIP30 and SNAP25 subcellular localization in primary motor neurons (b). Our results support a role for peripherin in vesicle trafficking.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,261

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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