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Enregistrement W2116414062 · doi:10.1002/ajmg.a.34074

Spectrum of <i>MLL2</i> (<i>ALR</i>) mutations in 110 cases of Kabuki syndrome

2011· article· en· W2116414062 sur OpenAlexaff
Mark Hannibal, Kati J. Buckingham, Sarah Ng, Jeffrey E. Ming, Anita E. Beck, Margaret J. McMillin, Heidi Gildersleeve, Abigail W. Bigham, Holly K. Tabor, Heather C. Mefford, Joseph Cook, Koh‐ichiro Yoshiura, Tadashi Matsumoto, Naomichi Matsumoto, Noriko Miyake, Hidefumi Tonoki, Kenji Naritomi, Tadashi Kaname, Toshiro Nagai, Hirofumi Ohashi, Kenji Kurosawa, Jia‐Woei Hou, Tohru Ohta, Deshung Liang, Akira Sudo, Colleen A. Morris, Siddharth Banka, Graeme C. Black, Jill Clayton‐Smith, Deborah A. Nickerson, Elaine H. Zackai, Tamim H. Shaikh, Dian Donnai, Norio Niikawa, Jay Shendure, Michael J. Bamshad

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésKabuki syndromeHaploinsufficiencyFrameshift mutationGeneticsMutationNonsense mutationBiologyGenePhenotypeMissense mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Kabuki syndrome is a rare, multiple malformation disorder characterized by a distinctive facial appearance, cardiac anomalies, skeletal abnormalities, and mild to moderate intellectual disability. Simplex cases make up the vast majority of the reported cases with Kabuki syndrome, but parent-to-child transmission in more than a half-dozen instances indicates that it is an autosomal dominant disorder. We recently reported that Kabuki syndrome is caused by mutations in MLL2, a gene that encodes a Trithorax-group histone methyltransferase, a protein important in the epigenetic control of active chromatin states. Here, we report on the screening of 110 families with Kabuki syndrome. MLL2 mutations were found in 81/110 (74%) of families. In simplex cases for which DNA was available from both parents, 25 mutations were confirmed to be de novo, while a transmitted MLL2 mutation was found in two of three familial cases. The majority of variants found to cause Kabuki syndrome were novel nonsense or frameshift mutations that are predicted to result in haploinsufficiency. The clinical characteristics of MLL2 mutation-positive cases did not differ significantly from MLL2 mutation-negative cases with the exception that renal anomalies were more common in MLL2 mutation-positive cases. These results are important for understanding the phenotypic consequences of MLL2 mutations for individuals and their families as well as for providing a basis for the identification of additional genes for Kabuki syndrome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,227
Score d'incertitude au seuil0,405

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations196
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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