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Enregistrement W2116461220 · doi:10.1093/toxsci/kft178

Incorporating New Technologies Into Toxicity Testing and Risk Assessment: Moving From 21st Century Vision to a Data-Driven Framework

2013· article· en· W2116461220 sur OpenAlexaff
Russell S. Thomas, Martin A. Philbert, Scott S. Auerbach, Barbara A. Wetmore, Michael J. DeVito, Ila Cote, J. Craig Rowlands, Maurice Whelan, Sean M. Hays, Melvin E. Andersen, M.E. Meek, Lawrence W. Reiter, Jason C. Lambert, Harvey J. Clewell, Martin L. Stephens, Qin Zhao, Scott C. Wesselkamper, Lynn Flowers, Edward W. Carney, Timothy P. Pastoor, Dan D. Petersen, Carole L. Yauk, Andy Nong

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEffects and risks of endocrine disrupting chemicals
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institutes of HealthU.S. Environmental Protection Agency
Mots-clésMetric (unit)ExtrapolationComputer scienceRisk assessmentChemical safetyIn vivoComputational biologyBiochemical engineeringStatisticsMathematicsBiologyEngineeringBiotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Based on existing data and previous work, a series of studies is proposed as a basis toward a pragmatic early step in transforming toxicity testing. These studies were assembled into a data-driven framework that invokes successive tiers of testing with margin of exposure (MOE) as the primary metric. The first tier of the framework integrates data from high-throughput in vitro assays, in vitro-to-in vivo extrapolation (IVIVE) pharmacokinetic modeling, and exposure modeling. The in vitro assays are used to separate chemicals based on their relative selectivity in interacting with biological targets and identify the concentration at which these interactions occur. The IVIVE modeling converts in vitro concentrations into external dose for calculation of the point of departure (POD) and comparisons to human exposure estimates to yield a MOE. The second tier involves short-term in vivo studies, expanded pharmacokinetic evaluations, and refined human exposure estimates. The results from the second tier studies provide more accurate estimates of the POD and the MOE. The third tier contains the traditional animal studies currently used to assess chemical safety. In each tier, the POD for selective chemicals is based primarily on endpoints associated with a proposed mode of action, whereas the POD for nonselective chemicals is based on potential biological perturbation. Based on the MOE, a significant percentage of chemicals evaluated in the first 2 tiers could be eliminated from further testing. The framework provides a risk-based and animal-sparing approach to evaluate chemical safety, drawing broadly from previous experience but incorporating technological advances to increase efficiency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,171
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,090
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,171
Score d'incertitude au seuil0,903

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1710,090
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0050,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,005
Bibliométrie0,0130,006
Études des sciences et des technologies0,0020,038
Communication savante0,0270,037
Science ouverte0,0150,015
Intégrité de la recherche0,0100,025
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations270
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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