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Enregistrement W2116614564 · doi:10.1186/1916-0216-42-57

Prognostic utility of basaloid differentiation in oropharyngeal cancer

2013· article· en· W2116614564 sur OpenAlexafffund
Timothy Cooper, Vincent L. Biron, Benjamin Adam, Alexander C. Klimowicz, Lakshmi Puttagunta, Hadi Seikaly

Notice bibliographique

RevueJournal of Otolaryngology - Head and Neck Surgery · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of Alberta Hospital
Organismes subventionnairesUniversity of Alberta
Mots-clésTissue microarrayMedicinePathologyCancerH&E stainImmunohistochemistryInternal medicineOncologyCarcinomaAnatomical pathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Human papillomavirus (HPV) is recognized as the key risk factor for a distinct subset of oropharyngeal squamous cell carcinoma. P16 is a reliable, sensitive surrogate marker for HPV and confers a positive prognostic advantage. Basaloid differentiation on hematoxylin and eosin (H&E) staining is anecdotally noted by some pathologists to be associated with p16 positivity. This association, however, has not been adequately quantified in the literature, nor has the prognostic implications of basaloid differentiation been described. OBJECTIVES: 1) To correlate the H&E staining feature of basaloid differentiation with p16 positivity in oropharyngeal cancer. 2) To investigate the prognostic utility of basaloid differentiation in oropharyngeal cancer survival. METHODS: Retrospective cross-sectional study of all patients diagnosed with and treated for oropharyngeal cancer at a single tertiary cancer center from 2002 to 2009. Tissue microarrays (TMAs) were generated from 208 oropharyngeal tumor specimens stained with H&E and immunohistochemical markers. These oropharyngeal TMAs were utilized in several previous publications. Samples were scored for basaloid differentiation by a pathologist blinded to the p16 result. A multivariate survival analysis with Cox-regression and Kaplan-Meier survival analysis was performed. RESULTS: In the 208 samples, basaloid differentiation correlated with p16 positivity (Spearman's rho 0.435). Basaloid differentiation and p16 positivity were both independent predictors of improved survival. The 5 year disease specific survival (DSS) was 73% for p16 positive tumors and 35% for p16 negative tumors (p < 0.001). Similarly, the 5 year DSS of basaloid differentiated tumors was 74% compared to 41% for non-basaloid tumors (p = 0.001). Patients with p16 positive and basaloid differentiated tumors had the best survival outcomes with a 5 year DSS of 80%. CONCLUSIONS: Basaloid differentiation is a feature on H&E which correlates with p16 positivity and is a simple, inexpensive, independent, positive prognostic indicator of comparable magnitude to p16 status. Due to the added prognostic value of basaloid differentiation, this feature should be routinely reported by qualified pathologists.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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