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Enregistrement W2116680353 · doi:10.1167/iovs.04-0107

Defining the Pathogenicity of<i>Optineurin</i>in Juvenile Open-Angle Glaucoma

2004· article· en· W2116680353 sur OpenAlexaff
Colin E. Willoughby, Louie Loh Yen Chan, Sarah Herd, Gail Billingsley, Nima Noordeh, Alex V. Levin, Yvonne M. Buys, Graham E. Trope, Mansoor Sarfarazi, Elise He ́on

Notice bibliographique

RevueInvestigative Ophthalmology & Visual Science · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlaucoma and retinal disorders
Établissements canadiensUniversity Health NetworkSickKids FoundationToronto Western HospitalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOptineurinGlaucomaIntraocular pressureBiologyGeneticsPopulationOpen angle glaucomaAlleleAllele frequencyOphthalmologyMutationMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Juvenile open-angle glaucoma (JOAG) differs from primary open-angle glaucoma in that it is usually a more severe phenotype and has an earlier age of onset. Optineurin was recently associated with a variant of POAG that is characterized by intraocular pressure within normal limits: normal-tension glaucoma. The present study tested whether OPTN sequence changes play a role in early-onset glaucoma characterized by elevated intraocular pressure. METHODS: Sixty-six patients with JOAG characterized by high intraocular pressure were screened for mutations. Mutational analysis was performed with a combination of restriction enzyme digestion, single-strand conformation polymorphism, and direct sequencing. The effects of select changes on exon splicing were assessed using bioinformatic modeling approaches and RT-PCR. RESULTS: Ten sequence changes were identified, of which H486R was strongly suggestive of pathogenicity. H486R represents the first reported OPTN mutation associated with JOAG. Also, L41L is proposed to confer an increased susceptibility to the development of JOAG. Most of the other sequence changes observed were not thought to be biologically significant. The frequency of the previously reported M98K allele was not increased in the JOAG population studied but showed the previously reported skewed distribution in the POAG study population. The changes identified were not shown to affect the splicing machinery. CONCLUSIONS: The results of this work support the hypothesis that mutations in OPTN are not specifically associated with low-pressure glaucoma, but can play a role in JOAG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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