MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2116706689 · doi:10.3201/eid1601.090369

Projecting Global Occurrence of<i>Cryptococcus gattii</i>

2009· article· en· W2116706689 sur OpenAlexaboutno aff
Deborah J. Springer, Vishnu Chaturvedi

Notice bibliographique

RevueEmerging infectious diseases · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity at AlbanyNew York State Department of Health - Wadsworth CenterNew York State Department of Health
Mots-clésCryptococcus gattiiCryptococcosisCryptococcus neoformansBiologyOutbreakCryptococcusPathogenNicheEcologyMicrobiologyVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cryptococcus gattii and C. neoformans cause pulmonary and systemic cryptococcosis. Recently, C. gattii was recognized as a distinct pathogen of humans and animals. We analyzed information from 400 publications (1948-2008) to examine whether the fungus occurs globally. Known distribution of C. gattii is possibly limited because specialized reagents for differentiation from C. neoformans are not readily available and not always used, and environmental surveys are patchy. However, autochthonous reports of C. gattii cryptococcosis have now been recognized from tropical and temperate regions. An ongoing outbreak in western Canada strengthens the case that the range of the pathogen has expanded. A few studies have highlighted differences in cryptococcosis between C. gattii and C. neoformans. More than 50 tree species have yielded C. gattii especially from decayed hollows suggesting a possible ecologic niche. This pathogen merits more attention so its environmental occurrence and role in cryptococcosis can be accurately determined.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations200
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEmerging infectious diseasesMême sujetFungal Infections and StudiesTravaux en français237 207