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Enregistrement W2116774028 · doi:10.2174/138920010794328931

PBPK Modeling of Intestinal and Liver Enzymes and Transporters in Drug Absorption and Sequential Metabolism

2010· review· en· W2116774028 sur OpenAlexaff
Jianghong Fan, Shu Chen, Edwin C.Y. Chow, K. Sandy Pang

Notice bibliographique

RevueCurrent Drug Metabolism · 2010
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhysiologically based pharmacokinetic modellingBioavailabilityTransporterFirst pass effectPharmacologyPharmacokineticsIn vivoDrug metabolismSmall intestineEffluxChemistryBiologyDrugBiochemistryBiotechnologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Experimental strategies have long been applied for in vitro or in vivo evaluation of the effect of transporters and/or enzymes on the bioavailability. However, the lack of specific inhibitors or inducers of transporters and enzymes and the multiplicity of nuclear receptors in gene regulation and cross-talk have led to compromised assessments of these effects in vivo. These and other causes have resulted in confusion and controversy in transporter-enzyme interplay. In this review, physiologically-based pharmacokinetic (PBPK) intestinal and liver models are utilized to predict the contributions of enzymes and transporters on intestinal availability (FI) and hepatic availability (FH), with the aim to fully understand the impact of these variables on bioavailability (Fsys) in vivo. We emphasize the often overlooked impact of influx and efflux clearances, and apply the PBPK models and their solutions to examine individual organ clearances of the intestine and liver. In order to accurately predict oral bioavailability, these organ models are incorporated into the whole body PBPK model, and additional complicated scenarios such as segmental differences and zonal heterogeneity of transporters and enzymes in the intestine and liver, and segregated blood flow patterns of the intestine are further discussed. The sequential metabolism of a drug to form primary and secondary metabolites in the first-pass organs is considered in PBPK modeling, revealing that the segregated flow model (SFM) of the intestine is more appropriate than the traditional PBPK intestinal model (TM). Examples are included to highlight the potential application of these PBPK models on the quantitative prediction of bioavailability. Keywords: Physiologically-based pharmacokinetic (PBPK) model, bioavailability, enzyme, transporter, liver, intestine, metabolism, excretion, area under the curve (AUC), clearance, PBPK Modeling of Intestinal and Liver Enzymes and Transporters in Drug Absorption and Sequential Metabolism, FH, Fsys, SFM, TM, GI, Lipophilic drugs, carboxylesterases, methyltransferase, P450s, cyclosporine, midazolam, nifedipine, enterocyte, hepatocyte, MCT1, MRP2, BCRP, OATPs, OCT1, BSEP, CAT, ACAT, Vmax, Km, PBPK, FI, Simcyp, Esterase/ enalaprilat, methyldopa sulfate, IVIVE, PLS, ANN, EHBR, availability, Heterogeneity, Zonal Liver Model, area under the curve, ADME, Sulfatase, ENZYMES, M3G, DPD

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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