MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2116786855 · doi:10.1091/mbc.e05-11-1027

Parkin-mediated Monoubiquitination of the PDZ Protein PICK1 Regulates the Activity of Acid-sensing Ion Channels

2007· article· en· W2116786855 sur OpenAlexafffund
Monica Joch, Ariel R. Ase, Carol X.‐Q. Chen, Penny A. MacDonald, Maria Kontogiannea, Amadou T. Corera, Alexis Brice, Philippe Séguéla, Edward A. Fon

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesKillam TrustsJohns Hopkins UniversityRIKEN Brain Science InstituteRIKENSanofi
Mots-clésParkinPDZ domainBiologyUbiquitin ligaseUbiquitinNeurodegenerationAcid-sensing ion channelCell biologyBiochemistryIon channelParkinson's diseaseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the parkin gene result in an autosomal recessive juvenile-onset form of Parkinson's disease. As an E3 ubiquitin-ligase, parkin promotes the attachment of ubiquitin onto specific substrate proteins. Defects in the ubiquitination of parkin substrates are therefore believed to lead to neurodegeneration in Parkinson's disease. Here, we identify the PSD-95/Discs-large/Zona Occludens-1 (PDZ) protein PICK1 as a novel parkin substrate. We find that parkin binds PICK1 via a PDZ-mediated interaction, which predominantly promotes PICK1 monoubiquitination rather than polyubiquitination. Consistent with monoubiquitination and recent work implicating parkin in proteasome-independent pathways, parkin does not promote PICK1 degradation. However, parkin regulates the effects of PICK1 on one of its other PDZ partners, the acid-sensing ion channel (ASIC). Overexpression of wild-type, but not PDZ binding- or E3 ubiquitin-ligase-defective parkin abolishes the previously described, protein kinase C-induced, PICK1-dependent potentiation of ASIC2a currents in non-neuronal cells. Conversely, the loss of parkin in hippocampal neurons from parkin knockout mice unmasks prominent potentiation of native ASIC currents, which is normally suppressed by endogenous parkin in wild-type neurons. Given that ASIC channels contribute to excitotoxicity, our work provides a mechanism explaining how defects in parkin-mediated PICK1 monoubiquitination could enhance ASIC activity and thereby promote neurodegeneration in Parkinson's disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations135
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular Biology of the CellMême sujetParkinson's Disease Mechanisms and TreatmentsTravaux en français237 207