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Enregistrement W2116808443 · doi:10.1038/tp.2015.159

Genome-wide analysis implicates microRNAs and their target genes in the development of bipolar disorder

2015· article· en· W2116808443 sur OpenAlexafffund
Andreas J. Forstner, Andrea Hofmann, Anna Maaser, Simon Sumer, Sharof Khudayberdiev, Thomas W. Mühleisen, Markus Leber, Thomas G. Schulze, Jana Strohmaier, Franziska Degenhardt, Jens Treutlein, Manuel Mattheisen, Johannes Schumacher, René Breuer, S Meier, Stefan Herms, Per Hoffmann, André Lacour, Stephanie H. Witt, Andreas Reif, Bertram Müller‐Myhsok, Susanne Lucae, Wolfgang Maier, Markus Schwarz, Helmut Vedder, Jutta Kammerer-Ciernioch, Andrea Pfennig, Michael Bauer, Martin Hautzinger, Susanne Moebus, Lutz Priebe, Sugirthan Sivalingam, A. Verhaert, Herbert Schulz, Piotr M. Czerski, Joanna Hauser, Jolanta Lissowska, Neonila Szeszenia‐Dąbrowska, Paul Brennan, James McKay, A. Jordan Wright, Philip B. Mitchell, Janice M. Fullerton, Peter R. Schofield, Grant W. Montgomery, Sarah E. Medland, Scott D. Gordon, Nicholas G. Martin, В. Краснов, А. Г. Чучалин, Gulja Babadjanova, Galina Pantelejeva, Л. И. Абрамова, Tiganov As, Alexey Polonikov, Э. К. Хуснутдинова, Martin Alda, Cristiana Cruceanu, Guy A. Rouleau, Gustavo Turecki, Catherine Laprise, Fatima Rivas, Fermín Mayoral, Manolis Kogevinas, Maria Grigoroiu‐Serbânescu, Peter Propping, Tim Becker, Marcella Rietschel, Sven Cichon, Gerhard Schratt, Markus M. Nöthen

Notice bibliographique

RevueTranslational Psychiatry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversité du Québec à ChicoutimiMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteMontreal Neurological Institute and HospitalDalhousie University
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNational Health and Medical Research CouncilUnitatea Executiva pentru Finantarea Invatamantului Superior, a Cercetarii, Dezvoltarii si InovariiAlfried Krupp von Bohlen und Halbach-StiftungLundbeckfondenWorld Health OrganizationEuropean CommissionWellcome TrustDeutsche ForschungsgemeinschaftHeinz Nixdorf StiftungBundesministerium für Bildung und ForschungCentre International de Recherche sur le Cancer
Mots-clésBipolar disordermicroRNAGenomeSchizophrenia (object-oriented programming)GeneGeneticsComputational biologyBiologyPsychiatryMedicineLithium (medication)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bipolar disorder (BD) is a severe and highly heritable neuropsychiatric disorder with a lifetime prevalence of 1%. Molecular genetic studies have identified the first BD susceptibility genes. However, the disease pathways remain largely unknown. Accumulating evidence suggests that microRNAs, a class of small noncoding RNAs, contribute to basic mechanisms underlying brain development and plasticity, suggesting their possible involvement in the pathogenesis of several psychiatric disorders, including BD. In the present study, gene-based analyses were performed for all known autosomal microRNAs using the largest genome-wide association data set of BD to date (9747 patients and 14 278 controls). Associated and brain-expressed microRNAs were then investigated in target gene and pathway analyses. Functional analyses of miR-499 and miR-708 were performed in rat hippocampal neurons. Ninety-eight of the six hundred nine investigated microRNAs showed nominally significant P-values, suggesting that BD-associated microRNAs might be enriched within known microRNA loci. After correction for multiple testing, nine microRNAs showed a significant association with BD. The most promising were miR-499, miR-708 and miR-1908. Target gene and pathway analyses revealed 18 significant canonical pathways, including brain development and neuron projection. For miR-499, four Bonferroni-corrected significant target genes were identified, including the genome-wide risk gene for psychiatric disorder CACNB2. First results of functional analyses in rat hippocampal neurons neither revealed nor excluded a major contribution of miR-499 or miR-708 to dendritic spine morphogenesis. The present results suggest that research is warranted to elucidate the precise involvement of microRNAs and their downstream pathways in BD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,093
Score d'incertitude au seuil0,304

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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