Actinomadura keratinilytica sp. nov., a keratin-degrading actinobacterium isolated from bovine manure compost
Notice bibliographique
Résumé
A novel keratinolytic actinobacterium, strain WCC-2265(T), was isolated from bovine hoof keratin 'baited' into composting bovine manure from southern Alberta, Canada, and subjected to phenotypic and genotypic characterization. Strain WCC-2265(T) produced well-developed, non-fragmenting and extensively branched hyphae within substrates and aerial hyphae, from which spherical spores possessing spiny cell sheaths were produced in primarily flexuous or straight chains. The cell wall contained meso-diaminopimelic acid, whole-cell sugars were galactose, glucose, madurose and ribose, and the major menaquinones were MK-9(H(6)), MK-9(H(8)), MK-9(H(4)) and MK-9(H(2)). These characteristics suggested that the organism belonged to the genus Actinomadura and a comparative analysis of 16S rRNA gene sequences indicated that it formed a distinct clade within the genus. Strain WCC-2265(T) could be differentiated from other species of the genus Actinomadura by DNA-DNA hybridization, morphological and physiological characteristics and the predominance of iso-C(16 : 0), iso-C(17 : 0) and 10-methyl C(17 : 0) fatty acids. The broad range of phenotypic and genetic characters supported the suggestion that this organism represents a novel species of the genus Actinomadura, for which the name Actinomadura keratinilytica sp. nov. is proposed; the type strain is strain WCC-2265(T) (=DSM 45195(T)=CCUG 56181(T)).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».