The Metabolic Reprogramming Evoked by Nitrosative Stress Triggers the Anaerobic Utilization of Citrate in Pseudomonas fluorescens
Notice bibliographique
Résumé
Nitrosative stress is an ongoing challenge that most organisms have to contend with. When nitric oxide (NO) that may be generated either exogenously or endogenously encounters reactive oxygen species (ROS), it produces a set of toxic moieties referred to as reactive nitrogen species (RNS). As these RNS can severely damage essential biomolecules, numerous organisms have evolved elaborate detoxification strategies to nullify RNS. However, the contribution of cellular metabolism in fending off nitrosative stress is poorly understood. Using a variety of functional proteomic and metabolomic analyses, we have identified how the soil microbe Pseudomonas fluorescens reprogrammed its metabolic networks to survive in an environment enriched by sodium nitroprusside (SNP), a generator of nitrosative stress. To combat the RNS-induced ineffective aconitase (ACN) and tricarboxylic acid (TCA) cycle, the microbe invoked the participation of citrate lyase (CL), phosphoenolpyruvate carboxylase (PEPC) and pyruvate phosphate dikinase (PPDK) to convert citrate, the sole source of carbon into pyruvate and ATP. These enzymes were not evident in the control conditions. This metabolic shift was coupled to the concomitant increase in the activities of such classical RNS detoxifiers as nitrate reductase (NR), nitrite reductase (NIR) and S-nitrosoglutathione reductase (GSNOR). Hence, metabolism may hold the clues to the survival of organisms subjected to nitrosative stress and may provide therapeutic cues against RNS-resistant microbes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».