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Enregistrement W2117085932 · doi:10.1111/j.1469-8749.2011.04080.x

Microarray as a first genetic test in global developmental delay: a cost-effectiveness analysis

2011· article· en· W2117085932 sur OpenAlexaffabout
Yannis Trakadis, Michael Shevell

Notice bibliographique

RevueDevelopmental Medicine & Child Neurology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMontreal Children's HospitalMcGill University
Organismes subventionnairesChildren's Hospital Foundation
Mots-clésConfidence intervalComparative genomic hybridizationMedicineMicroarrayGenetic testingCost effectivenessOncologyInternal medicineBiologyGeneticsChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: Microarray technology has a significantly higher clinical yield than karyotyping in individuals with global developmental delay (GDD). Despite this, it has not yet been routinely implemented as a screening test owing to the perception that this approach is more expensive. We aimed to evaluate the effect that replacing karyotype with array-based comparative genomic hybridization (aCGH) would have on the total cost of the workup for GDD. METHOD: We evaluated the cost-effectiveness of aCGH compared with karyotyping by retrospectively analysing the cost of workup in a cohort of 114 children (69 males; 45 females) representing a consecutive series of children diagnosed with GDD. RESULTS: The average increase in cost if aCGH had been performed instead of karyotyping as a first test was $442 per individual when performed by a private company (98% confidence interval $238-604). In contrast, $106 (98% confidence interval -$17 to $195) would have been saved if aCGH was performed locally in a laboratory already possessing the required technology. The incremental cost per additional diagnosis was estimated to be $12,874 if aCGH was performed in a private laboratory, but <$1379 if performed locally. (Costs reported in Canadian dollars, using 2010 prices.) INTERPRETATION: aCGH would be cost-effective as a first genetic test in the clinical evaluation of individuals with GDD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,054

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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