Identification of Novel NPRAP/δ-Catenin-Interacting Proteins and the Direct Association of NPRAP with Dynamin 2
Notice bibliographique
Résumé
Neural plakophilin-related armadillo protein (NPRAP or δ-catenin) is a neuronal-specific protein that is best known for its interaction with presenilin 1 (PS1). Interestingly, the hemizygous loss of NPRAP is associated with severe mental retardation in cri du chat syndrome (CDCS), and mutations in PS1 cause an aggressive, early-onset form of Alzheimer's disease. Until recently, studies on the function of NPRAP have focused on its ability to modulate dendritic protrusion elaboration through its binding to cell adhesion and scaffolding molecules. However, mounting evidence indicates that NPRAP participates in intracellular signaling and exists in the nucleus, where it modulates gene expression. This apparent bifunctional nature suggests an elaborate neuronal role, but how NPRAP came to participate in such distinct subcellular events remains a mystery. To gain insight into this pathway, we immunoprecipitated NPRAP from human SH SY5Y cells and identified several novel interacting proteins by mass spectrometry. These included neurofilament alpha-internexin, interferon regulatory protein 2 binding factors, and dynamins 1 and 2. We further validated dynamin 2/NPRAP colocalization and direct interaction in vivo, confirming their bona fide partnership. Interestingly, dynamin 2 has established roles in endocytosis and actin assembly, and both of these processes have the potential to interface with the cell adhesion and intracellular signaling processes that involve NPRAP. Our data provide new avenues for approaching NPRAP biology and suggest a broader role for this protein than previously thought.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».