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Enregistrement W2117162399 · doi:10.1093/hmg/ddm160

A stop codon mutation in SCN9A causes lack of pain sensation

2007· article· en· W2117162399 sur OpenAlexaffabout
Sultan Ahmad, Leif Dahllund, Anders Eriksson, Dennis Hellgren, Urban Karlsson, Per-Eric Lund, Inge A. Meijer, Luc Meury, Tracy Mills, Adrian Moody, Anne Morinville, John Morten, Dajan O’Donnell, Carina Raynoschek, Hugh Salter, Guy A. Rouleau, Johannes Krupp

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversité de MontréalAstraZeneca (Canada)
Organismes subventionnairesAstraZeneca
Mots-clésBiologyGeneticsGeneMutationTransversionSodium channelLocus (genetics)Molecular biologyStop codonPhenotypeHaploinsufficiencyEndocrinologySodium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The general lack of pain experience is a rare occurrence in humans, and the molecular causes for this phenotype are not well understood. Here we have studied a Canadian family from Newfoundland with members who exhibit a congenital inability to experience pain. We have mapped the locus to a 13.7 Mb region on chromosome 2q (2q24.3-2q31.1). Screening of candidate genes in this region identified a protein-truncating mutation in SCN9A, which encodes for the voltage-gated sodium channel Na(v)1.7. The mutation is a C-A transversion at nucleotide 984 transforming the codon for tyrosine 328 to a stop codon. The predicted product lacks all pore-forming regions of Na(v)1.7. Indeed, expression of this altered gene in a cell line did not produce functional responses, nor did it cause compensatory effects on endogenous voltage-gated sodium currents when expressed in ND7/23 cells. Because a homozygous knockout of Na(v)1.7 in mice has been shown to be lethal, we explored why a deficiency of Na(v)1.7 is non-lethal in humans. Expression studies in monkey, human, mouse and rat tissue indicated species-differences in the Na(v)1.7 expression profile. Whereas in rodents the channel was strongly expressed in hypothalamic nuclei, only weak mRNA levels were detected in this area in primates. Furthermore, primate pituitary and adrenal glands were devoid of signal, whereas these two glands were mRNA-positive in rodents. This species difference may explain the non-lethality of the observed mutation in humans. Our data further establish Na(v)1.7 as a critical element of peripheral nociception in humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,075

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations186
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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