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Enregistrement W2117226764 · doi:10.1111/j.1529-8817.2004.03070.x

PHYLOGEOGRAPHY OF <i>GRACILARIA TIKVAHIAE</i> (GRACILARIACEAE, RHODOPHYTA): A STUDY OF GENETIC DISCONTINUITY IN A CONTINUOUSLY DISTRIBUTED SPECIES BASED ON MOLECULAR EVIDENCE<sup>1</sup>

2004· article· en· W2117226764 sur OpenAlexaboutno aff
Carlos Frederico D. Gurgel, Suzanne Fredericq, James N. Norris

Notice bibliographique

RevueJournal of Phycology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhylogeographyBiologyLineage (genetic)Phylogenetic treeRange (aeronautics)Internal transcribed spacerTaxonGenetic structureEvolutionary biologyPhylogeneticsCoalescent theoryEcologyMolecular clockCeramialesGenetic variationAlgaeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gracilaria tikvahiae , a highly morphologically variable red alga, is one of the most common species of Gracilariaceae inhabiting Atlantic estuarine environments and the Intracoastal Waterway of eastern North America. Populations of G. tikvahiae at the extremes of their geographic range (Canada and southern Mexico) are subjected to very different environmental regimes. In this study, we used two types of genetic markers, the chloroplast‐encoded rbc L and the nuclear internal transcribed spacer (ITS) region, to examine the genetic variability within G. tikvahiae , for inferring the taxonomic and phylogenetic relationships between geographically isolated populations, and to discuss its distributional information in a phylogeographic framework. Based on rbc L and ITS phylogenies, specimens from populations collected at the extreme distributional ranges reported for G. tikvahiae are indeed part of the same species; however, rbc L‐ but not ITS‐based phylogenies detected phylogenetic structure among the ten G . tikvahiae different haplotypes found in this study. The four distinct rbc L lineages were identified as 1) a Canadian–northeast U.S. lineage, 2) a southeast Florida lineage, 3) an eastern Gulf of Mexico lineage, and 4) a western Gulf of Mexico lineage. We found no evidence for the occurrence of G. tikvahiae in the Caribbean Sea. Observed phylogeographic patterns match patterns of genetic structures reported for marine animal taxa with continuous and quasicontinuous geographic distribution along the same geographic ranges.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,081
Score d'incertitude au seuil0,780

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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