MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2117231907 · doi:10.1139/cjm-2015-0415

Filament formation of <i>Salmonella</i> Paratyphi A accompanied by FtsZ assembly impairment and low level ppGpp

2015· article· en· W2117231907 sur OpenAlexvenueno aff
Takayoshi Yamaguchi, Ken-ichiro Iida, Susumu Shiota, Hiroaki Nakayama, Shin�ichi Yoshida

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiologyProtein filamentSalmonellaFtsZBiologyEnterobacteriaceaeChemistryBacteriaBacterial proteinEscherichia coliBiochemistryGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previously, we reported that Salmonella enterica serovar Paratyphi A strain S602 grew into multinuclear, nonseptate, and nonlethal filaments on agar plates containing nitrogenous salts. Strain S602 was more sensitive to osmotic and oxidative stress than the reference strain 3P243 of nonfilamentous Salmonella Paratyphi A. Strain S602 had an amber mutation (C154T) in rpoS. The revertant of this mutant, SR603, was repressed to form filaments under conditions with abundant nitrogenous salts. However, 3PR244, an rpoS mutant of 3P243 (C154T), did not form filaments, which implies that the rpoS mutation is not the sole cause of filamentation in strain S602. Next, we examined whether the level of guanosine 5'-diphosphate 3'-diphosphate (ppGpp) in S602 strain is involved in filament formation. The intracellular ppGpp level in filamentous cells was lower than that in nonfilamentous cells. Furthermore, cells belonging to strain RE606, a derivative of S602 where the intracellular concentration of ppGpp was increased by overexpression of the relA gene, exhibited normal Z-ring formation and cell division. In the S602 strain, the decrease in the ppGpp level induced by the presence of nitrogenous salt and the rpoS mutation led to the inhibition of Z-ring formation and the subsequent filamentation of cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of MicrobiologyMême sujetBacterial Genetics and BiotechnologyTravaux en français237 207