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Enregistrement W2117242714 · doi:10.1093/ndt/gfm135

Expression of filtrin in human glomerular diseases

2007· article· en· W2117242714 sur OpenAlexaff
Pekka Ihalmo, Holger Schmid, Maria Pia Rastaldi, Deborah Mattinzoli, Robyn G. Langham, Pauliina Luimula, Riika Kilpikari, Markus Lassila, R. E. Gilbert, Dontscho Kerjaschki, Matthias Kretzler, H. Holthofer

Notice bibliographique

RevueNephrology Dialysis Transplantation · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalInstitute of Genetics
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNephrinPodocinPodocyteSlit diaphragmMedicineFocal segmental glomerulosclerosisPathologyProteinuriaHousekeeping geneGlomerulosclerosisGene expressionKidneyInternal medicineBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Filtrin (NEPH3/KIRREL2) is a recently characterized member of the nephrin-like proteins of the immunoglobulin superfamily, and it has been suggested to participate in the maintenance of the glomerular filtration barrier in the kidney. In this study, the gene and protein expression of filtrin were examined in patients with acquired proteinuric diseases. METHODS: Filtrin mRNA levels in renal biopsies were measured with quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) in two sets of patients with proteinuria. The mRNA levels were normalized to the housekeeping gene GAPDH and also related to the podocyte-specific genes nephrin and podocin. Immunofluorescence microscopy was employed to explore changes in the glomerular distribution of filtrin. RESULTS: Reduced glomerular expression of filtrin mRNA was observed in all studied diagnostic groups. In focal segmental glomerulosclerosis, the filtrin mRNA level was only one-tenth of the control samples (P approximately 5.0x10(-6)), and this finding was confirmed in a second set of samples. The ratios of filtrin to nephrin and podocin demonstrated a marked decrease in the expression of filtrin relative to the podocyte marker genes. However, no correlation between the expression of filtrin and the levels of serum creatinine and proteinuria was observed. Immunostaining showed changes in the expression pattern of filtrin in renal biopsies. Immunoelectron microscopic studies localized filtrin at the slit diaphragm of the podocyte foot processes. CONCLUSIONS: Down-regulation of the filtrin gene and protein expression in the renal biopsies together with the localization to the inter-podocyte filtration slit imply a potential role for this molecule in the pathogenesis of proteinuric diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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