Heterodimerization of ecdysone receptor and ultraspiracle on symmetric and asymmetric response elements
Notice bibliographique
Résumé
Heterodimerization of nuclear receptors is facilitated by the interaction of two dimerization interfaces: one spanning the DNA-binding (C domain) region and the adjacent hinge (D domain) region, and the other in the ligand-binding (E domain) region. Ultraspiracle (USP) heterodimerizes with ecdysone receptor (EcR) and this complex participates in ecdysone signal transduction. The natural ecdysone response elements (EcREs) discovered so far are asymmetric elements composed of either imperfect palindromes or direct repeats. However, gel mobility shift assays have shown that both symmetric (perfect palindromes) and asymmetric (imperfect palindromes and direct repeats) elements can bind to the EcR/USP complex. Therefore, we analyzed EcR/USP domains involved in heterodimerization on different types of response elements (RE). Gel shift assays using full-length and truncated EcR and USP proteins showed that heterodimerization of these two proteins in the presence of asymmetric RE (DR4 and the natural EcRE hsp27) requires both dimerization interfaces present in CD and E domains of both proteins. In contrast, the dimerization interface present in the E domain of either EcR or USP was not essential for heterodimerization on symmetric RE such as PAL1 or IR1. We conclude that the use of heterodimerization interfaces present in CD and E domains of EcR/USP depends on the nature of response elements they bind to.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».