Heritable Variation of<i>ERBB2</i>and Breast Cancer Risk
Notice bibliographique
Résumé
Amplification of the epithelial growth factor receptor gene ERBB2 (HER2, NEU) in breast cancer is associated with a poor clinical prognosis. In mammary gland development, this receptor plays a role in ductal and lobuloalveolar differentiation. We conducted a systematic investigation of the role of genetic variation of the ERBB2 gene in breast cancer risk in a study of 842 histologically confirmed invasive breast cancer cases and 1,108 controls from the Shanghai Breast Cancer Study. We observed that the ERBB2 gene resides within a locus of high linkage disequilibrium, composed of three major ancestral haplotypes in the study population. These haplotypes are marked by simple tandem repeat and single nucleotide polymorphisms, including the missense variants I655V and P1170A. We observed a risk-modifying effect of a highly polymorphic simple tandem repeat within an evolutionarily conserved region, 4.4 kb upstream from the ERBB2 transcription start site. Under a dominant genetic model, the age-adjusted odds ratio was 1.74 (95% confidence interval, 1.27-2.37). Its association with breast cancer, and with breast cancer stratified by histology, by histologic grade, and by stage, remained significant after correction for multiple comparisons. In contrast, we observed no association of ERBB2 single nucleotide polymorphism haplotypes with breast cancer predisposition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».