Structural asymmetry in the magnesium channel CorA points to sequential allosteric regulation
Notice bibliographique
Résumé
Magnesium ions (Mg(2+)) are essential for life, but the mechanisms regulating their transport into and out of cells remain poorly understood. The CorA-Mrs2-Alr1 superfamily of Mg(2+) channels represents the most prevalent group of proteins enabling Mg(2+) ions to cross membranes. Thermotoga maritima CorA (TmCorA) is the only member of this protein family whose complete 3D fold is known. Here, we report the crystal structure of a mutant in the presence and absence of divalent ions and compare it with previous divalent ion-bound TmCorA structures. With Mg(2+) present, this structure shows binding of a hydrated Mg(2+) ion to the periplasmic Gly-Met-Asn (GMN) motif, revealing clues of ion selectivity in this unique channel family. In the absence of Mg(2+), TmCorA displays an unexpected asymmetric conformation caused by radial and lateral tilts of protomers that leads to bending of the central, pore-lining helix. Molecular dynamics simulations support these movements, including a bell-like deflection. Mass spectrometric analysis confirms that major proteolytic cleavage occurs within a region that is selectively exposed by such a bell-like bending motion. Our results point to a sequential allosteric model of regulation, where intracellular Mg(2+) binding locks TmCorA in a symmetric, transport-incompetent conformation and loss of intracellular Mg(2+) causes an asymmetric, potentially influx-competent conformation of the channel.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».