Characteristics of adjacent family 6 acetylxylan esterases from<i>Fibrobacter succinogenes</i>and the interaction with the Xyn10E xylanase in hydrolysis of acetylated xylan
Notice bibliographique
Résumé
Acetylxylan esterase genes axe6A and axe6B located adjacent to one another on a Fibrobacter succinogenes chromosome have been separately cloned and their properties characterized. The corresponding esterases contained an N-terminal carbohydrate esterase family 6 catalytic domain (CD) and a C-terminal family 6 carbohydrate-binding module (CBM). The amino acid sequences of the CDs and CBMs were found to exhibit 52% and 40% amino acid similarity, respectively. The CDs of the two esterases exhibited the highest similarity to CDs of acetylxylan esterases: AxeA from the ruminal fungi Orpinomyces sp. and BnaA from Neocallimastix patriciarum. Axe6A and Axe6B were optimally active at neutral pH and had low K(m) values of 0.084 and 0.056 mmol x L(-1), respectively. Axe6A and Axe6B were shown to bind to insoluble cellulose and xylan and to soluble arabinoxylan. Axe6A deacetylated acetylated xylan at the same initial rate in the presence and absence of added Xyn10E xylanase from F. succinogenes, but the action of the xylanase on acetylated xylan was dependent upon the initial activity of Axe6A. The capacity of acetylxylan esterases to bind to plant cell wall polymers and to independently deacetylate xylan enabling xylanase to release xylooligo saccharides, documents the central role these enzymes have to improve access of F. succinogenes to cellulose.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».