An aphid lineage maintains a bark‐feeding niche while switching to and diversifying on conifers
Notice bibliographique
Résumé
Lachnine aphids are unusual among phytophagous insects because they feed on both leafy and woody parts of both angiosperm and conifer hosts. Despite being piercing-sucking phloem-feeders, these aphids are most speciose on woody parts of coniferous hosts. To evaluate the significance of this unusual biology on their evolution, we reconstructed the ancestral host and feeding site of the lachnine aphids and estimated important host shifts during their evolution. We sampled 78 species representing 14 of the 18 genera of Lachninae from Asia and North America. We performed parsimony, Bayesian and likelihood phylogenetic analyses of combined mitochondrial Cox1, Cox2, CytB and nuclear EF1a1 DNA sequences. We dated the resulting phylogram's important nodes using Bayesian methods and multiple fossil and secondary calibrations. Finally, we used parsimony and Bayesian ancestral state reconstruction to evaluate ancestral feeding ecology. Our results suggest the lachnine common ancestor fed on a woody part of an angiosperm host in the mid-Cretaceous. A shift to conifer hosts in the Late Cretaceous is correlated with a subsequent increased diversification in the Palaeogene, but a switch to leafy host tissues did not engender a similar burst of diversification. Extant lachnine lineages exhibit the full range of historical association with their hosts: some appeared before, some concomitant with and some after the appearance of their hosts. We conclude our study by placing all the lachnine genera in five tribes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».