Phylogeographic History of White Spruce During the Last Glacial Maximum: Uncovering Cryptic Refugia
Notice bibliographique
Résumé
Although a recent study of white spruce using chloroplast DNA uncovered the presence of a glacial refuge in Alaska, chloroplast failed to provide information on the number or specific localities of refugia. Recent studies have demonstrated the utility of nuclear microsatellites to refine insights into postglacial histories. The greater relative rate of mutation may allow finer scale resolution of historic dynamics, including the number, location, and sizes of refugia. Genetic data were acquired from screening 6 microsatellite loci on approximately 14 trees from each of 22 populations located across the central and western boreal forests of Canada and Alaska. Our studies combining microsatellites with Bayesian analyses of population structure in white spruce support the phylogeographic patterns uncovered using chloroplast, separating Alaskan from non-Alaskan regions. Results also support the idea that north-central Alaska served as a glacial refugium during the last glacial maximum. Additionally, the relationship between the degree of genetic differentiation and geographic distance indicated that gene flow played a more important role in structuring non-Alaskan populations, whereas drift played a more important role in structuring Alaskan populations (R(ST)'s for non-Alaskan populations 0.029 ± 0.007 and 0.083 ± 0.012 for Alaskan populations). Microsatellites also substantiate the bidirectional patterns of gene flow previously uncovered using chloroplast DNA but indicate much greater movement and mixing. Results from our Bayesian analyses also suggest the existence of additional cryptic refugia. However, the locations have been obscured by high gene flow (R(ST) averaging 0.057 ± 0.004).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».