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Enregistrement W2117656568 · doi:10.1093/jhered/esq110

Phylogeographic History of White Spruce During the Last Glacial Maximum: Uncovering Cryptic Refugia

2010· article· en· W2117656568 sur OpenAlexaboutno aff
Lynn L. Anderson, Feng Sheng Hu, Ken N. Paige

Notice bibliographique

RevueJournal of Heredity · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhylogeographyGene flowBiologyRefugium (fishkeeping)Glacial periodMicrosatelliteTaigaEcologyGenetic structureLast Glacial MaximumPopulationIsolation by distanceDemographic historyEvolutionary biologyGenetic variationPhylogeneticsPaleontologyHabitatGeneGeneticsAlleleDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although a recent study of white spruce using chloroplast DNA uncovered the presence of a glacial refuge in Alaska, chloroplast failed to provide information on the number or specific localities of refugia. Recent studies have demonstrated the utility of nuclear microsatellites to refine insights into postglacial histories. The greater relative rate of mutation may allow finer scale resolution of historic dynamics, including the number, location, and sizes of refugia. Genetic data were acquired from screening 6 microsatellite loci on approximately 14 trees from each of 22 populations located across the central and western boreal forests of Canada and Alaska. Our studies combining microsatellites with Bayesian analyses of population structure in white spruce support the phylogeographic patterns uncovered using chloroplast, separating Alaskan from non-Alaskan regions. Results also support the idea that north-central Alaska served as a glacial refugium during the last glacial maximum. Additionally, the relationship between the degree of genetic differentiation and geographic distance indicated that gene flow played a more important role in structuring non-Alaskan populations, whereas drift played a more important role in structuring Alaskan populations (R(ST)'s for non-Alaskan populations 0.029 ± 0.007 and 0.083 ± 0.012 for Alaskan populations). Microsatellites also substantiate the bidirectional patterns of gene flow previously uncovered using chloroplast DNA but indicate much greater movement and mixing. Results from our Bayesian analyses also suggest the existence of additional cryptic refugia. However, the locations have been obscured by high gene flow (R(ST) averaging 0.057 ± 0.004).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,759
Score d'incertitude au seuil0,261

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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