MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2117667316 · doi:10.1093/hmg/dds425

A meta-analysis of genome-wide association studies to identify prostate cancer susceptibility loci associated with aggressive and non-aggressive disease.

2013· review· en· W2117667316 sur OpenAlex
Ali Amin Al Olama, Fredrick R. Schumacher, Fredrik Wiklund, Sonja I. Berndt, Sara Benlloch, Graham G. Giles, Gianluca Severi, David E. Neal, Freddie C. Hamdy, Jenny Donovan, David J. Hunter, Brian E. Henderson, Michael J. Thun, Michael Gaziano, Edward L. Giovannucci, Afshan Siddiq, Ruth C. Travis, David G. Cox, Federico Canzian, Elio Ríboli, Timothy J. Key, Gerald L. Andriole, Demetrius Albanes, Richard B. Hayes, Johanna Schleutker, Anssi Auvinen, Teuvo L.J. Tammela, Maren Weischer, Janet L. Stanford, Elaine A. Ostrander, Cezary Cybulski, Jan Lubiński, Stephen N. Thibodeau, Daniel J. Schaid, Karina D. Sørensen, Jyotsna Batra, Judith A. Clements, Suzanne K. Chambers, Joanne F. Aitken, Robert A. Gardiner, C. Maier, Walther Vogel, Thilo Dörk, Hermann Brenner, Tomonori Habuchi, Sue A. Ingles, Esther M. John, Joanne L. Dickinson, Manuel R. Teixeira, Radka Kaneva, H.-W. Zhang, Yong‐Jie Lu, J Y Park, Kathleen A. Cooney, Kenneth Muir, Daniel Leongamornlert, Edward J. Saunders, Malgorzata Tymrakiewicz, Nadiya Mahmud, Michelle Guy, Koveela Govindasami, Lynne T. O'Brien, Rosemary Wilkinson, Amanda L. Hall, Emma Sawyer, Tokhir Dadaev, Jean Morrison, David P. Dearnaley, Alan Horwich, Robert Huddart, Vincent Khoo, Chris Parker, Nicholas van As, Christopher Woodhouse, Alan Thompson, Tim Dudderidge, Chris Ogden, Christopher S. Cooper, Aritaya Lophatonanon, Melissa C. Southey, John L. Hopper, Dallas R. English, Jarmo Virtamo, Loı̈c Le Marchand, Susan M. Gapstur, Jan Adolfsson, Guangwen Cao

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueResearch Explorer (The University of Manchester) · 2013
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensInstitute of Aging
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesVersus ArthritisCancer Research UKNational Cancer InstituteNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésBiologyMeta-analysisProstate cancerGenome-wide association studyDiseaseGeneticsGenetic associationSingle-nucleotide polymorphismOncologyBioinformaticsCancerGeneInternal medicineGenotypeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genome-wide association studies (GWAS) have identified multiple common genetic variants associated with an increased risk of prostate cancer (PrCa), but these explain less than one-third of the heritability. To identify further susceptibility alleles, we conducted a meta-analysis of four GWAS including 5953 cases of aggressive PrCa and 11 463 controls (men without PrCa). We computed association tests for approximately 2.6 million SNPs and followed up the most significantSNPs by genotyping 49 121 samples in 29 studies through the international PRACTICAL and BPC3 consortia. We not only confirmed the association of a PrCa susceptibility locus, rs11672691 on chromosome 19, but also showed an association with aggressive PrCa [odds ratio = 1.12 (95% confidence interval 1.03-1.21), P = 1.4 × 10-8]. This report describes a genetic variant which is associated with aggressive PrCa, which is a type of PrCa associated with a poorer prognosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,344
Score d'incertitude au seuil0,939

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,184
Tête enseignante GPT0,399
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle