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Enregistrement W2117691109 · doi:10.1099/vir.0.2008/002139-0

Arabidopsis thaliana class II poly(A)-binding proteins are required for efficient multiplication of turnip mosaic virus

2008· article· en· W2117691109 sur OpenAlex
Philippe J. Dufresne, Éliane Ubalijoro, Marc Fortin, Jean‐François Laliberté

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche ScientifiqueMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésTurnip mosaic virusBiologyArabidopsis thalianaPotyvirusMolecular biologyVirologyMessenger RNAMutantRNAPlant virusGeneVirusGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The poly(A)-binding protein (PABP) is an important translation initiation factor that binds to the polyadenylated 3' end of mRNA. We have previously shown that PABP2 interacts with the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and VPg-Pro of turnip mosaic virus (TuMV) within virus-induced vesicles. At least eight PABP isoforms are produced in Arabidopsis thaliana, three of which (PABP2, PABP4 and PABP8) are highly and broadly expressed and probably constitute the bulk of PABP required for cellular functions. Upon TuMV infection, an increase in protein and mRNA expression from PAB2, PAB4 and PAB8 genes was recorded. In vitro binding assays revealed that RdRp and the viral genome-linked protein (VPg-Pro) interact preferentially with PABP2 but are also capable of interaction with one or both of the other class II PABPs (i.e. PABP4 and PABP8). To assess whether PABP is required for potyvirus replication, A. thaliana single and double pab knockouts were isolated and inoculated with TuMV. All lines showed susceptibility to TuMV. However, when precise monitoring of viral RNA accumulation was performed, it was found to be reduced by 2.2- and 3.5-fold in pab2 pab4 and pab2 pab8 mutants, respectively, when compared with wild-type plants. PABP levels were most significantly reduced in the membrane-associated fraction in both of these mutants. TuMV mRNA levels thus correlated with cellular PABP concentrations in these A. thaliana knockout lines. These data provide further support for a role of PABP in potyvirus replication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,270
Score d'incertitude au seuil0,300

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle