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Enregistrement W2117763542 · doi:10.1016/j.ejcts.2009.12.018

Prognostic value of p53 mutations in oesophageal adenocarcinoma: final results of a 15-year prospective study

2010· article· en· W2117763542 sur OpenAlexafffund
Koroush Madani, Ronghua Zhao, Hyun J. Lim, Alan G. Casson

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Cardio-Thoracic Surgery · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEsophageal Cancer Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanRoyal University Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteDalhousie University
Mots-clésAdenocarcinomaImmunohistochemistryHazard ratioStage (stratigraphy)GastroenterologyInternal medicineProportional hazards modelPathologicalMedicineEsophagusMutationConfidence intervalExonPathologyOncologyBiologyCancerGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: This study evaluates the clinical significance of p53 mutations in oesophageal adenocarcinoma (EADC). METHODS: Between February 1991 and February 2006, 142 consecutive patients with EADC underwent potentially curative oesophageal resection. No patient received induction therapy. Strict clinicopathologic criteria were used to define primary EADC (Type I), excluding gastric cardia adenocarcinoma (Type II). Genomic DNA was extracted from oesophageal tumours, each with matched histologically normal oesophageal epithelium (internal control) from the resection margin. Polymerase chain reaction was used to amplify p53 exons 4-10, and mutations were characterised by direct DNA sequencing. The p53 mutations were correlated with clinicopathologic findings, p53 protein expression determined using immunohistochemistry, and outcome using Kaplan-Meier and Cox proportional hazards models. RESULTS: For all patients, 5-year overall survival (OS) was 26.9%. Conventional predictors of reduced OS included advanced pathological tumour-node-metastasis (pTNM) stage (P<0.0001) and number of involved lymph nodes (0, 1-3, >3; P<0.0001). No p53 mutations were found in normal oesophageal epithelia. A total of 47% of tumours (67/142) had p53 mutations, predominantly G:C to A:T transitions at CpG dinucleotides (36/67). The p53 mutations were associated with p53 protein overexpression (P<0.0001) and poor tumour differentiation (P=0.037). Patients whose tumours had p53 mutations had significantly reduced 5-year OS (hazard ratio (HR): 1.54; 95% confidence interval (CI): 1.03-2.3; P=0.03). CONCLUSIONS: Patterns of p53 mutations in EADC suggest endogenous molecular mechanisms. The p53 mutations are a predictor of significantly reduced postoperative survival following surgical resection of EADC, and would appear to be a clinically useful molecular prognostic biomarker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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