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Enregistrement W2117788964 · doi:10.1111/j.1439-0426.2008.01088.x

The molecular phylogeny of the order Acipenseriformes revisited

2008· article· en· W2117788964 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Ichthyology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIdentification and Quantification in Food
Établissements canadiensCegep de Sept Iles
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMonophylyAcipenserCladePhylogenetic treeHusoPhylogeneticsMaximum parsimonyEvolutionary biologyZoologyCytochrome bMitochondrial DNAMolecular phylogeneticsGenusSturgeonGeneticsGeneFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As evolutionary relationships within the order Acipenseriformes are not well understood and some classifications are currently controversial, the study of evolutionary relationships, especially based on genetic data, has received much recent attention. In this reanalysis we present a nearly complete proposed phylogeny of the order, including 25 species, based on the maximum likelihood analysis of combined DNA sequence data (4406 base pairs) from five mitochondrial genes sequenced in our laboratories (cytochrome b, 12S rRNA, cytochrome c oxidase subunit II, tRNAAsp and tRNAPhe) and three mitochondrial gene regions sequenced by Birstein et al. (2002) (16S rRNA, NADH5 and control region). Examination of the molecular phylogeny using either maximum likelihood, Bayesian analysis, maximum parsimony or neighbor-joining leads to the following conclusions: (i) the two species of paddlefish do form a clade; (ii) the most basal position within the Acipenseridae remains unresolved, held either by the genus Scaphirhynchus or by the clade containing Acipenser oxyrinchus and A. sturio; (iii) Huso is not monophyletic, with the two species of Huso found embedded separately within the genus Acipenser; (iv) A. sinensis and A. dabryanus are confirmed as closely related; (v) the previously described Atlantic-Pacific subdivision within the Acipenser/Huso complex is supported and (vi) the unexpected placement of Pseudoscaphirhynchus kaufmanni within Acipenser is supported by this analysis. These results offer further evidence that some revision of acipenseriform classification may be needed to accurately inform conservation efforts and that future phylogenetic studies of this group should focus on the analysis of nuclear genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,154
Score d'incertitude au seuil0,205

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle