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Enregistrement W2117847966 · doi:10.1128/jvi.79.15.9588-9596.2005

Utilization of Homotypic and Heterotypic Proteins of Vesicular Stomatitis Virus by Defective Interfering Particle Genomes for RNA Replication and Virion Assembly: Implications for the Mechanism of Homologous Viral Interference

2005· article· en· W2117847966 sur OpenAlexafffund
Gyoung Nyoun Kim, C. Yong Kang

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVirology and Viral Diseases
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésVesicular stomatitis virusBiologyVirologyRNAViral replicationRhabdoviridaeVirusSmall interfering RNAGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Defective interfering (DI) particles of Indiana serotype of vesicular stomatitis virus (VSV(Ind)) are capable of interfering with the replication of both homotypic VSV(Ind) and heterotypic New Jersey serotype (VSV(NJ)) standard virus. In contrast, DI particles from VSV(NJ) do not interfere with the replication of VSV(Ind) standard virus but do interfere with VSV(NJ) replication. The differences in the interfering activities of VSV(Ind) DI particles and VSV(NJ) DI particles against heterotypic standard virus were investigated. We examined the utilization of homotypic and heterotypic VSV proteins by DI particle genomic RNAs for replication and maturation into infectious DI particles. Here we show that the RNA-nucleocapsid protein (N) complex of one serotype does not utilize the polymerase complex (P and L) of the other serotype for RNA synthesis, while DI particle genomic RNAs of both serotypes can utilize the N, P, and L proteins of either serotype without serotypic restriction but with differing efficiencies as long as all three proteins are derived from the same serotype. The genomic RNAs of VSV(Ind) DI particles assembled and matured into DI particles by using either homotypic or heterotypic viral proteins. In contrast, VSV(NJ) DI particles could assemble only with homotypic VSV(NJ) viral proteins, although the genomic RNAs of VSV(NJ) DI particles could be replicated by using heterotypic VSV(Ind) N, P, and L proteins. Thus, we concluded that both efficient RNA replication and assembly of DI particles are required for the heterotypic interference by VSV DI particles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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