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Enregistrement W2117858761 · doi:10.1186/1742-4690-6-s3-o45

S03-06 OA. Rapid perforin upregulation by CD8 T cells in elite controllers as a correlate of immune-mediated control of HIV replication

2009· article· en· W2117858761 sur OpenAlexaff
AR Hersperger, Florencia Pereyra, Korey Demers, Prameet M. Sheth, L. B. Shin, Benigno Rodríguez, Scott F. Sieg, Luciella Teixeira-Johnson, Paul Goepfert, M. M. Lederman, Rupert Kaul, George Makedonas, BD Walker, MR Betts

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPerforinDownregulation and upregulationReplication (statistics)MedicineImmune systemCD8ImmunologyHuman immunodeficiency virus (HIV)VirologyCytotoxic T cellComputational biologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Evidence suggests that CD8 T cells are important to the control of HIV replication in elite controllers. However, the mechanism behind the enhanced suppressive capacity of CD8 T cells in these subjects remains unclear. We have recently discovered the novel ability of human CD8 T cells to rapidly upregulate perforin following antigen-specific stimulation. Using polychromatic flow cytometry and standard intracellular cytokine staining assays, we measured perforin expression, cytokine production, and degranulation by CD8 T cells following stimulation using overlapping peptide pools encompassing the entire HIV proteome. We studied several HIV-infected groups that differentially control viral replication off therapy: elite controllers (n = 34), viremic controllers (n = 29), chronic progressors (n = 24), and viremic nonprogressors (n = 6). We observe that on average 40% of the total CD8 T cell response in elite controllers is perforin-positive following HIV-specific stimulation compared to 20% in the other cohorts. However, the proportion of the HIV-specific CD8 T cell response that produces IFN-gamma does not vary widely between the groups. Elite controllers have a significantly larger proportion of responding CD8 T cells that degranulate yet remain perforin-positive following 6 hours of stimulation, suggesting that CD8 T cells in these individuals have an increased capacity to upregulate new perforin production. The cells that express perforin, which are enriched in elite controllers, display almost entirely an effector phenotype (CD27negCD45ROnegCD57+/-). Overall, there is a strong negative correlation (p < 0.0001) between HIV-specific perforin expression and viral load. This finding is not simply the result of the low viral load in elite controllers as HIV-specific perforin expression is not restored in HAART-suppressed patients (n = 12). The rapid perforin upregulation displayed by CD8 T cells in elite controllers may contribute to the superior control of HIV replication in these subjects. Continuous perforin expression following initial antigen encounter allows for the sustained cytotoxic potential of anti-viral CD8 T cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,604
Score d'incertitude au seuil0,695

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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