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Enregistrement W2118029674 · doi:10.1074/jbc.m414132200

A Novel Diacylglycerol-lactone Shows Marked Selectivity in Vitro among C1 Domains of Protein Kinase C (PKC) Isoforms α and δ as Well as Selectivity for RasGRP Compared with PKCα

2005· article· en· W2118029674 sur OpenAlexaff
Yongmei Pu, Nicholas A. Perry, Dazhi Yang, Nancy E. Lewin, Noémi Kedei, Derek C. Braun, Sung Hee Choi, Peter M. Blumberg, Susan H. Garfield, James C. Stone, Dehui Duan, Víctor E. Márquez

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtein kinase CDiacylglycerol kinaseChinese hamster ovary cellBiologyMyristoylationGene isoformPhosphorylationKinaseBiochemistryCell biologyChemistryPhorbolMolecular biologyReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although multiple natural products are potent ligands for the diacylglycerol binding C1 domain of protein kinase C (PKC), RasGRP, and related targets, the high conservation of C1 domains has impeded the development of selective ligands. We characterized here a diacylglycerol-lactone, 130C037, emerging from a combinatorial chemical synthetic strategy, which showed substantial selectivity. 130C037 gave shallow binding curves for PKC isoforms alpha, beta, gamma, delta, and epsilon, with apparent Ki values ranging from 340 nm for PKCalpha to 29 nm for PKCepsilon. When binding to isolated C1 domains of PKCalpha and -delta, 130C037 showed good affinity (Ki= 1.78 nm) only for deltaC1b, whereas phorbol 12,13-dibutyrate showed affinities within 10-fold for all. In LNCaP cells, 130C037 likewise selectively induced membrane translocation of deltaC1b. 130C037 bound intact RasGRP1 and RasGRP3 with Ki values of 3.5 and 3.8 nm, respectively, reflecting 8- and 90-fold selectivity relative to PKCepsilon and PKCalpha. By Western blot of Chinese hamster ovary cells, 130C037 selectively induced loss from the cytosol of RasGRP3 (ED50 = 286 nm), partial reduction of PKCepsilon (ED50 > 10 microm), and no effect on PKCalpha. As determined by confocal microscopy in LNCaP cells, 130C037 caused rapid translocation of RasGRP3, limited slow translocation of PKCepsilon, and no translocation of PKCalpha. Finally, 130C037 induced Erk phosphorylation in HEK-293 cells ectopically expressing RasGRP3 but not in control cells, whereas phorbol ester induced phosphorylation in both. The properties of 130C037 provide strong proof of principle for the feasibility of developing ligands with selectivity among C1 domain-containing therapeutic targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,746

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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